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来源：生命科学 关 薇, 王 建, 贺福初*（军事医学科学院放射与辐射医学研究所，北京 100850）
关键词：蛋白质相互作用；酵母双杂交；串联亲和纯化
GUAN Wei, WANG Jian, HE Fu-Chu*
Abstract: In 2000, the first network of large-scale protein-protein
another hot spot of protein research. Subsequently, such proteins interaction
years. So rapid progress in large-scale protein-protein interactions turned up
actually it also suggested the development and complement of research method
large-scale protein-protein interactions and showed their differences. Anyway,
Key words: protein-protein interaction; yeast two hybrid; tandem affinity
人类基因组测序的完成标志着一个新的生物学研究时代——后基因组时代(post-genomic era)的来临。科学家们的研究热点又回到蛋白质上，全基因组的序列信息并不足以解释及推测细胞的各种生命现象，蛋白质才是细胞活性及功能的ZZ执行者。构成细胞的所有组成蛋白有多少；他们的动态相互作用关系又如何；细胞内所有蛋白即蛋白质组又是怎样组织在一起形成有功能、有秩序的网络结构？
1 大规模蛋白质相互作用研究的目的及意义
；另一方面，某些蛋白质可能参与了不止一个的复合体，简单的两两相互作用研究就不足以阐明这种更为复杂的相互作用，因此，大规模、高通量的蛋白质相互作用研究应运而生，其目的是在细胞的特定生理条件下，从一个蛋白到多个蛋白，从一个复合体到多个复合体，进而描绘出整个蛋白质组中蛋白间相互作用的网络图。基于这些作用关系，科学家们才能从真正意义上阐明一个蛋白质的功能，才有可能研究细胞中某一生理活动中所有相关蛋白质的变化及作用机制。大规模蛋白质相互作用的研究还有助于了解细胞中不同生命活动之间的相互关系。
研究蛋白质相互作用时要根据不同的实验目的及条件选择不同的实施策略。研究已知蛋白间的相互作用人们关注的是蛋白间能否发生结合，实验本身更趋向于验证性，因此，应选择操作性强、可信度高、接近生理条件的技术方法，尽量减少实验本身带来的假阴性或假阳性。若研究者想得到细胞中能与某一蛋白结合的所有未知蛋白质，则实验的关键是得到细胞中含有靶蛋白的复合体，经过有效地分离纯化后，逐一鉴定复合物中的各个组分；或者采用一对多的筛选方法，如酵母双杂交，在建立的蛋白表达文库中检测可能与靶蛋白相互作用的蛋白质。值得注意的是在这一策略中实验结果的进一步验证是必不可少的。目前用于大规模研究蛋白质间相互作用的方法包括酵母双杂交、串联亲和纯化、质谱鉴定、蛋白芯片以及基于生物信息学的分析方法等。
