| 实验步骤 | 材料 缓冲液和溶液
10 mmol/LHEPES-KOH(pH7.9) 10mmol/LKCl 0.5 mmol/L 苯 含 0.05%(V/V)NonidetP-40 的细胞匀浆缓冲液 细胞重悬缓冲液 0.4mol/LKCl 10%(V/V) 甘油 0.1%(m/V) 抑蛋白酶肽
40 mml/LTris-Cl(pH7.4) 0.15mol/LNaCl
Ficoll 溶解在无菌水中,分装成 100ul 并冻存在-20°C。 甲酰胺染色液 10 mg 二甲苯青 FF 贮存于室溫。 MgCl2/CaCl2 溶液 5 mmoI/LCaCl2
聚乙烯醇溶解在无菌水中,分装成 100ul 并冻存在-20°C。 终止液 1%(m/V)SDS 125ug/ml 酵母 tRNA 组织匀浆液 25 mmol/LKCl 0.5 mmol/L 亚梢胺 2mol/L 蔗糖 该缓冲液在使用前需要冰浴预冷。根据需要,步骤 1 前要加人 0.5 mmol/L 苯(PMSF)、1ug/ml 亮抑酶肽、1ug/ml 抑胃酶肽等蛋白酶YZ剂。 组织重悬缓冲液 1.5 mmol/LMgCl2 0.5 mmol/L 苯 贮存于 0°C。 台盼蓝染料(0.4%m/V)
酶溶于 10 mmol/L Tris-Cl(pH8.0), 分装成小份并冻存在-20°C。恰好在步骤 3 以前把溶液以 1:100稀释于冰浴的 10 mmol/L Tris-Cl(pH8.0)。 凝胶 6% 或 8% 的变性聚丙烯酰胺测序胶(见第 12 章方案 8) 核酸与寡核苷酸 poly(dI-dC)(lmg/ml)
通常由靶 DNA 片段进行 Maxam-Gilbert 测序实验中的(A+G) 反应组成。化学测序的方法请参见第 12 章的方案 7。此外也可以使用双脱氧终止法测序反应(第 12 章,方案 3~6), 所用 DNA 的 5'端与 DNA 酶 I 切割得到的 DNA 片段的放射性末端相同。 放射性化合物 32P 末端标记的 DNA[长度 200~500bp, 比活性≥2.5X107cpm/ug(≥5000cpm/fmol)] 反应中使用的 DNA 片段长度应该为 200~500bp。感兴趣的结合位点至少离放射标记末端 30bp。如果使用更长的 DNA 片段,测序胶的分辨率会变弱。结合位点离末壩太近可能不被 DNA 结合蛋白或 DNA 酶 I 识别。 离心机和转头 Beckman SW28 转头或类似产品,预冷到 4°C
带 B 型研杵的 Dounce 匀浆器 橡胶棒 辅助试剂
新鲜组织、培养的细胞、来自细胞或组织的蛋白成分
方法 1. 用下列 3 种方法中的一种制备核提取物。此外,纯化细胞蛋白得到的组分可以直接用于步骤 2。 从组织制备核提取物 a. 解剖 10~15 g 组织并剪碎。加入冰冷的组织匀浆缓冲液,使碎组织的体积调整到 30 ml。用带紧型研杵的 Dounce 匀浆器勻浆,直到镜检确定大于 80%~90% 的细胞已经破碎。 b. 检测裂解情况是用 10ul 细胞悬液加相同体积 0.4% 台盼蓝染液,在装有 20 倍物镜的显微镜下观察溶液。裂解的细胞吸收染液,被染成蓝色,而完整的细胞不被染色,仍然是透明的。继续进行组织匀浆直到大于 80%~90% 的细胞已经破碎。 C. 匀浆物用冰冷的组织匀浆缓冲液稀释到 85 ml。在晶型塑料或超明亮型吊桶式离心管中放入 10 ml 冰冷的组织匀浆缓冲液,取 27 ml 稀释的匀浆物铺在上面。以 103900 g(用 Beckman SW28 转头是 24000r/min)在 4°C 离心 40 min。 d. 去掉上清,离心管倒置 1~2 min 使溶液流干。然后把离心管放在冰上。
本方法适用于转染有质粒的细胞,这些质粒能表达编码转录因子的 cDNA。 a. 细胞用细胞淋洗缓冲液洗若干次。每个培养皿加入1ml 细胞淋洗缓冲液,用橡胶棒把细胞刮到缓冲液中。 b. 细胞悬液转移到 1.5 ml 离心管中,室温下用ZD速度离心 2 min 沉淀细胞。 c. 对于原来在每个直径为 150 mm 的培养皿中培养的细胞,加 300ul 细胞重悬液重悬细胞,然后进行 3 次冻融。 d. 在 4°C 以ZD速度离心 5 min 去掉细胞碎片。上清(即细胞裂解物)分装成小份贮存在-70°C。 2. 在 1.5 ml 离心管中加入: 32P 末端标记的 DNA 1~10fmol H2O 加到 25ul 20%Ficoll 400 12ul 10% 聚乙烯醇 10ul
不含核提取物情况下用 DNA 酶 I 消化后的对照 DNA 含有核提取物但不含有 DNA 酶 I 情况下培养后的靶 DNA 9. 用足够的恒定功率跑胶,温度维持在 45~50°C。
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