装填缓冲液是CE分离的基本要求，对毛细管进行清洗则是保持自由溶液CEGX和重现分离的条件之一。采用正压或负压容易实现毛细管的填灌或冲洗，所需的机构和压力进样一样，包括位置控制、压力控制和计时控制等部分。商品仪器通常与进样共享压力控制，唯时间控制以分钟计，精度可降低。
图9-2-4是一种简单有效的注射器清洗器结构。利用这种方法可以洗通许多堵塞的毛细管。
