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UVP的凝胶电泳分析软件使用方法

在各个论坛上看以过许多凝胶电泳分析的软件,但没有UVP使用的Labwork的介绍。
如果你购买了UVP的凝胶电泳拍摄及分析系统,上面就会带一个labwork分析软件。打开这个软件你就可以发现其界面非常熟悉,原来这就是Media Cybernetics公司利用Imageproplus程序的内核专门应用于分析凝胶电泳图片的软件。上面还有许多Imageproplus的功能呢。

分析电泳图片还是很简单的,两分钟就能学会,只要在那个1D-Gel工具条从上往下一个一个点开来设置一下就OK。
打开一个图片后,先要把图片上的电泳条带摆得横平竖直,加样孔处于图片上方。这一步只要点DY个菜单rotate,然后用鼠标转图片就是。
第二步是指定泳道。点Lanes.利用弹出的菜单可以删掉或添加泳道,用鼠标可以拖动泳道位置,还可以在泳道上下边拖来延长或缩短泳道长度。
泳道宽度设置时,先勾上Uniform lanes width,然后在最上面的lanes width上把数值加大或减小一些。让选择泳道宽度框全部覆盖住条带。

设置完了泳道,再设置条带。
占bands菜单,在dark bands bright background与bright band dard background之间选一个(DNA凝胶是白带黑背景,蛋白质凝胶是黑带白背景),min band height设一个稍大的值(别太小,否则自动找到一大堆条带还得一个个删)。



 

设置完泳道与条带,下一条是设置背景。前面还有个加样孔位置要设置,因为我们已经把加样孔放到上方了,就不必设置它了。
背景的较正方法有许多选择,但只有一个实用。就是joining valleys.上一帖图中峰下面有一根斜线,那就是背景扣除的界限。下面的面积被扣除。只计算背景线上方的区域作为条带定量的依据。
最麻烦的是设置marker参数。
点marker菜单,弹出设置窗口,上面是指定marker泳道位置的按纽。系统默认DY泳道为marker。但我们经常把marker放到另的泳道上去。这块胶上有两个marker,分别在DY与第十三泳道上,设定方法是:
点reset清除掉窗口,再点select/unsel...按纽。在DY与第十二泳道上分别点一下,窗口中会出现lane 1和lane 13字样,说明这两个泳道被指定为marker。

 

下一步要指定Marker中各条带的分子量。
2.在下面的数字窗口中输入DY个分子量数字(2000)。点一下旁边的勾。
4.可见DY个分子量数据已经显示到窗口里了。
6.点OK回到上一个窗口,可以看见marker的分子量已经输入。

点一下auto loc按纽,这里要注意,如果是六个marker条带,则marker泳道里一定得有正好不多不少六个选定的条带。否则就乱套了。
有时候电泳跑得歪,两个marker的对应条带并不在同一水平面上,这时要作校正。把上面那个automatic slant correction选项给勾上。

 

对于泳道条带跑得歪,又作了两个marker时,可以用slant进一步校正。点slant按纽调出窗口。
1.点add slant line按纽,出来一个新对话框。
3.回到上一个窗口还是点OK。 

 










2016-08-08
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