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循环测序:利用 PCR 和引物末端标记进行双脱

           

试剂、试剂盒

ddNTP 延伸 终止混合物 酶及其缓冲液 AmpliTaq CS 或其他无外切酶活性的 DNA 聚合酶 循环测序缓冲液 热稳定的 DNA 聚合酶 核酸和寡核苷酸 模板 DNA

仪器、耗材

小离心管 或者微孔板 热循环仪

实验步骤

材料
溶液和缓冲液
贮存液、缓冲液和试剂的配方请参照附录 1。


dNTP 溶液:四种 dNTPs, 各 1.0 mmol/L
甲酰胺上样缓冲液



200 mmol/LTris-Cl(pH8.8)
2
热稳定的 DNA 聚合酶

寡核苷酸引物,5'端由 33P 或 32P 放射性标记

质粒、黏粒、λ噬菌体和噬菌体 M13DNA 以及通过第 1~4 章中任何方法得到的 DNA 都可以用作模板。表 12-12 表明了每种摸板的需要量(同时参考表 12-4)。
特殊装置
小离心管(0.5 ml) 或者微孔扳(柔软,热稳定,96 个 300ul 溶剂 U 型孔)
设计好的热循环程序(见步骤 5)。
方法
1.将每一种ddNTP混合物(参考表12-11)各4ul放入相应的0.5ml离心管或微孔板中。置于冰上。

2.在每管/孔中加人:
双链DNA模板                                                    10~100fm
5X循环测序缓冲液                                             2.0ul

33P末端标记的引物:使用5pm标准制备的由33P放射性标记的寡核苷酸(参见附录方法:使用PCR和[a-32P]dNTP内部标记进行的循环测序反应为保证测序混合物的化学计量。可在不增加反应体积的情况下将DNA量增加3倍(30—300fm)。
3.在1X循环测序缓冲液中将AmpliTaq CS聚合酶溶解至0.5~1.0U/ul。将1ul溶解好的酶溶液加入孔或管中。
4.轻弹管壁或摇动微孔板使物质混合。如果需要,在反应上加一滴矿物油,盖上管盖,2000r/m离心2s。确认矿物油未被紫外线照射过.否则会产生PCR的强YZ剂。
5.将管或微孔板放入PCR仪,预热到95°C。依据以下程序操作。







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2016-09-10
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