swath定量 | swath定量蛋白质组

    SWATH（Sequential Window Acquisition of all THeoretical Mass Spectra）是瑞士苏黎世联邦理工学院的Ruedi Aebersold 博士及其团队与AB-SCIEX联合推出的一项全新的质谱技术。SWATH采集模式是一种新型的MS/MS 扫描技术，它将扫描范围划分为以25 Dalton 为间隔的一系列区间，通过超高速扫描来获得扫描范围内全部离子的所有碎片信息，是 MS/MSALL技术的扩展。SWATH技术是一种真正全景式的、高通量的质谱技术，同时也大大提高了定量的可重现性。

　金开瑞现有的Triple-TOF 5600-plus质谱系统，使SWATH定量具有较高的准确度和动态范围，可检测到蛋白质的丰度差异极大，跨越4个数量级。且SWATH方法的灵敏度和动态范围与SRM分析水平相当。

    经过多年的研发，金开瑞已成功开发SWATH定量与分析技术，现为国内SJ推出SWATH技术服务的公司！


一、服务特色

技术特点

1、灵敏度高：SWATH技术继承了MRM的数据采集模式，结合高分辨率的AB sciex Triple TOF-plus，具有与MRM相当的灵敏度；

2、可重现性高：重复样品间的定量相关性可达到0.99以上；

3、定量准确度高：定量准确度几乎与MRM技术相当；

4、线性动态范围广：定量范围可跨越4个数量级；

5、通量大：一次实验可检测到2000种以上蛋白并定量。

适用范围

物种具有基因组序列、ESTs序列或蛋白质参考序列

Z好检测细菌等复杂度较低的样品

可以和MRMHR技术联合使用发现生物标志物

可以和TAP技术联合使用鉴定相互作用蛋白

 
二、服务说明

服务流程

接受订单及样品——蛋白提取——蛋白质定量——还原烷基化、酶切——除盐、抽干——HPLC分离——LC-MS/MS DDA模式质谱检测——LC-SWATH模式质谱检测——生物信息分析——结果交付

客户提供

需鉴定的样品；

样品信息单，需详细填写样品来源、含量、状态及其他基本信息。

交付

实验报告一份，含具体实验流程及蛋白质组鉴定及定量结果（生物信息学分析）。

生物信息学分析内容包括：

SWATH 参考谱图数据库构建：通过DDA模式的扫描结果，谱图数据库构建、全谱鉴定及结果可靠性评估

SWATH定量：根据二级碎片离子的全扫描结果实现二级离子的定量；SWATH结果可靠性分析；差异表达分析；层次聚类；PCA分析等。

蛋白质功能注释：包括GO注释、COG分类和KEGG Pathway分析

差异蛋白功能富集：包括GO富集、Pathway富集

差异蛋白网络互作：基于STRING 数据库的PPI分析，基于Cytoscape的可视化展示

 
三、服务周期及报价

服务周期

自送样起45个工作日。

 服务报价

请询价。

如您对多克隆抗体定制感兴趣或者需要技术支持，请您与我联系QQ：3013422302 ，或者浏览我们公司的网站http://www.genecreate.cn/，可以搜索到您想要的服务信息，武汉金开瑞生物有限公司期待和您的合作。