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单细胞及微量细胞全基因组甲基化测序 (scWGBS)

产品信息
  • scWGBS(单/微量细胞全基因组重亚硫酸盐甲基化测序技术)


     
    产品提供商:  易基因生物


    服务名称:微量单细胞全基因组甲基化测序(scWGBS)科研服务


    原理: 单细胞及微量样本的DNA甲基化组学研究很大程度上受限于建库测序技术scWGBS在常规全基因组重亚硫酸盐建库技术上进行改进,建库全过程都在同一个PCR管中进行,限度降低了DNA的损失,实现珍惜样本的全基因组甲基化建库(可同时完成单细胞甲基化WGBS建库和RNA Smart2建库测序)。   



    技术优势:






    实验策略:



    分析内容:






    送样要求:

    样品要求:由客户提供的已分离的单细胞或微量细胞:
    DNA送样量:a.微量基因组DNA小于1ng。b.微量FFPE穿刺组织提取的DNA小于1ng(单个细胞,少量细胞等稀有样本或者5pg以上的基因组DNA)
    样品纯度:OD260/280=1.8~2.0
    测序深度:≥30x
    应用范围:血液游离DNA(cfDNA),石蜡组织切片FFPE等微量样本。
    周期:15个样本以下标准运转周期约为60个工作日。由于不同的物种所需的数据量不同,所需的建库数据量差别很大,因此遇样品数较多时,项目周期需要与技术支持人员确定。


    研究案例:







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    BS类 IP类 染色质类


    sc RNA



    Meta



    scWGBS+scRNA
    WGBS MeDIP ATAC-seq lncRNA



    LHC-BS+ssRNA
    scWGBS hMeDIP   原核转录组  
    RRBS/dRRBS CHIP   有/无参考基因组  
    oxBS 6mA   ceRNA  
    ACE-seq m6A      
    LHC-BS        

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