Illumina二代基因测序系统

Illumina MiSeq基因测序仪
 
技术特性：

· 现有NGS平台中Z短的实验周期：从样品制备开始只需要8小时即可得到超过100M的高质量测序结果。
· 现有NGS平台中Z便捷的样品制备流程：只需50ngDNA模板，2小时的自动化操作就可以完成全部样品制备工作。
· 现在NGS平台中Z精确的测序原理：MiSeq继续GA和HiSeq平台的边合成边测序的化学原理，数千篇高质量的国际期刊文章是对   Illumina NGS平台测序结果可信度Z有力的证明。
· 现在NGS平台中Z完整的整合功能：MiSeq可以独立完成簇生成，双向测序及数据分析工作，让经费和实验室空间不再成为NGS研究的障碍。
 
Z短的时间内获得答案，智能化的工作流程，广泛的测序应用范围

 Illumina公司推出的MiSeq是目前WY一台在单个仪器上整合了扩增、测序和数据分析的新一代测序仪，每次运行能产生超过1 Gb的数据，且占地面积仅为2平方英尺。MiSeq有着革命性的流程和无可比拟的准确性，这让它成为快速且经济GX的遗传分析的理想平台，适合广泛的应用。同时根据Illumina的消息，今年9月份左右，MiSeq系统的测序通量将会升级至7G左右。升级将通过两个方面完成，一个是cluster密度的增大，升级后cluster密度将会增加至12-15million，而pair-end读取的reads数目将会增加至24-30million；另一方面是通过测序读长而提升通量，届时测序读长会达到2*250bp，同时测序速度也会有所提升。目前，Broad研究院已经利用现有试剂实现了单端测序300bp读长，Illumina目前内部测序更是完成了2*400bp的pair-end测序。而这些，都是保证在高质量数据结果的前提下完成的。

MiSeq性能参数
 

读长	测序时间	数据量	数据质量
1×35bp	4小时	>120 M	>90% 数据高于Q30
2×100bp	19小时	>680 M	>80% 数据高于Q30
2×150bp	27小时	>1 GB	>75% 数据高于Q30

四大特性

1、Z短的实验周期：从样品制备开始只需要8小时即可得到超过100M的高质量测序结果。
2、Z便捷的样品制备流程：只需50ngDNA模板，2小时的自动化操作就可以完成全部样品制备工作。
3、Z精确的测序原理：MiSeq继续GA和HiSeq平台的边合成边测序的化学原理，数千篇高质量的国际期刊文章是对Illumina NGS平台测序结果可信度Z有力的证明。
4、Z完整的整合功能：MiSeq可以独立完成簇生成，双向测序及数据分析工作，让经费和实验室空间不再成为NGS研究的障碍。

应用范围

1、转录组测序
派森诺MiSeq测序平台是基因组已测序物种的转录组分析平台。公司技术团队目前已完成了包括斑马鱼在内的多种植物、动物的转录组测序及分析。
2、宏基因组16S rDNA单V区测序
对16s rDNA的单V区(V3\V4)进行高通量测序，鉴定细菌群和古生菌群。派森诺的技术团队使用Illumina MiSeq测序16S rDNA V4区并结合Roche 454 FLX+测序16S rDNA V1~V3区成功的对鸡的肠道环境细菌进行了鉴定。
3、Small RNA测序
1*35bp的读长地配合了小RNA的测序长度，速度快，灵敏度高。派森诺的技术团队目前已完成了鹅的小RNA测序和多种中草药的小RNA测序。
4、重测序：
包括全基因组重测序、简化基因组测序、外显子测序。
Illumina MiSeq非常适用于对微生物基因组的重测序，每次运行即可完成一个微生物基因组测序。2011年12月27日，派森诺的技术团队利用MiSeq一次运行同时完成了乳酸菌
（Lactobacillus casei Zhang和Lactobacillus casei P8）的重测序，基因组覆盖深度为分别为404倍和213倍，比对至参考序列，基因组覆盖率为，同时检测到了多种结构变异，包括插入、缺失和SNP位点，并且检测到了全部质粒。
 
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