16S/18S/ITS微生物多样性（肠道菌群）测序

产品简介

扩增子测序，即对特定长度的PCR产物或者捕获的片段进行测序，主要包括16S rDNA测序、18S rDNA测序及ITS测序等。扩增子测序通常是选择某个或某几个变异区域，利用保守区设计通用引物进行PCR扩增，然后对高变区进行测序分析和菌种鉴定，具有所需样本量少、高通量和高精确性等特点。

数据分析策略

1.从测序所得的原始数据出发，首先对原始数据进行质控，得到有效数据（Clean Data）；

2.基于有效数据进行OTUs（Operational Taxonomic Units）聚类；

3.根据OTUs聚类结果，一方面对每个OTU的代表序列做物种注释，得到对应的物种信息，另一方面将各个样品的有效数据，和代表序列进行比对，获得对应OTU在各个样品中的丰度分布情况；

4.基于构建好的OTU丰度表，获得不同分类层级的物种丰度表；

5.基于OTU丰度表及不同分类层级的丰度表，进行样品微生物群落组成分析；

6.基于OTU丰度表及不同分类层级的丰度表，进行Alpha多样性和Beta多样性分析；

7.根据研究需求，可选择高级分析，深入挖掘样品中的物种组成和差异。

数据分析内容

分析类别	分析内容
样品微生物群落组成分析	样品菌落组成柱状图
	Heatmap图
	样品间OTU分布Venn图
Alpha diversity分析	多样性指数统计
	稀释曲线（Rarefaction Curve）	多样性组间差异
	Chao1曲线
	Shannon-Wiener 曲线	LEfSe分析
	Rank-Abundance 曲线
Beta diversity分析	样品间相似性指数
	PCoA分析
	样品聚类分析
高级分析菜单	RDA/CCA 分析	NMDS分析
	关联分析	Network分析
	PICRUSt 分析	随机森林分析