DNA 羟甲基化测序（hMeDIP-Seq）技术服务

实验技术简介：DNA羟甲基化是一种重要的表观遗传修饰，对基因的表达起调控作 用，在神经分化和癌症中发挥重要的作用。为深入了解5hmC的作用，我们就必须清楚 5hmC在基因组的分布情况。然而，传统的基于Bisulfite的方法无法区分5-hmC和5-mc。5-hmC单克隆抗体捕获法是研究DNA羟基化修饰的利 器，结合高通量测序技术以及生物信息分析，可以获得全基因组羟甲基化分布图，从而能帮助我们从一个新的角度来解析胚胎发育，神经细胞分化以及癌症发生的分 子机制。

实验操作流程：
1、羟甲基化DNA免疫共沉淀（hMeDIP）
2、测序文库构建
3、DNA成簇（Cluster）扩增
4、高通量测序
5、数据分析
6、提供实验报告

 

实验注意事项：
客户提供：
1、样品量：细胞样品请提供至少5×10⁶个细胞，组织样品请提供至少100mg的组织块或切片。DNA样品请提供2μg以上的基因组DNA。
2、样品质量：DNA无明显降解，OD260/280值在1.7～1.9之间，浓度≥ 50ng/μl。
3、样品保存：细胞样品或新鲜组织块（切成～50mg的小块）用液氮速冻后，-80℃保存。DNA样品可溶于的超纯水或TE（PH8.0）中，-20℃短期保存或者-80℃长期保存。样品保存期间避免反复冻融。
4、样品运输：细胞或组织样品置于1.5 ml管中，封口膜封好，干冰运输。DNA样本放离心管或者PCR板中，密封后，冰袋运输。
5、需要检测的羟甲基化位点信息。
6、目的基因或转录因子的相关背景资料。
交付标准：
1、提供实验报告原始数据报告Fasta-Q格式包含所有测序序列信息碱基
2、读取质量评估基本数据分析报告Excel表格包含有效序列的序列信息、与参考基因组比对后的注释信息等。