NimbleGen SeqCap甲基化序列富集方案
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通过“超级”探针设计实现单碱基分辨率的定向甲基化测序
上海伯豪NimbleGen SeqCap Epi甲基化富集服务
上海伯豪全新推出NimbleGen SeqCap Epi基因组DNA甲基化序列富集产品,伯豪公司利用该产品并结合二代测序,可进行在单碱基分辨率的样品甲基化分析。上海伯豪该产品系列包括:固定内容的、人类全基因组水平的可甲基化位点的DNA片段富集方案;以及,适合于各种不同应用的由客户自选区域的目标序列富集产品。该产品系列可以为表观遗传研究人员提供全新的研究工具,相比现有其他技术,可以在更大DNA序列广度,更高测序深度和更大样本量水平下进行DNA甲基化研究。
1. 服务特色
研究具有生物学意义的甲基化改变
样品间具有良好的可重复性
探针具有捕获各种不同甲基化状态,不同甲基化程度的能力
2. 实验流程(先重亚硫酸处理后捕获)
3. 产品介绍
(1)目录产品(包装数:4,48, 384 Rxn)
A. SeqCap Epi CpGiant Enrichment Kit
– 全基因组水平的甲基化位点富集,包括了Illumina’s Infinium Human Methylation 450 BeadChip的所有位点及其附近的区域
– 覆盖人类基因组上>5.5 million个CpG位点
(2)SBC designed Content
A. SeqCap Epi MouseCpGi Enrichment Kit
– 小鼠全基因组水平的甲基化位点富集,设计覆盖27,465个CpG岛区域及(xxx数量)基因的启动子区域
– 覆盖小鼠基因组上>(xxx数量)million个CpG位点
B.SeqCap Epi RatCpGi Enrichment Kit
– 大鼠全基因组水平的甲基化位点富集,设计覆盖25,133个CpG岛区域及(xxx数量)基因的启动子区域
– 覆盖大鼠基因组上>(xxx数量)million个CpG位点
(3)Custom Content(包装数:12,48, 384 Rxn)
A.SeqCap Epi Choice Enrichment Kits
– 人类基因组特定区域定制设计
– 小区域 <30Mb, 中等区域 30-60Mb, 以及大区域 60-90Mb均可设计
B.SeqCap Epi Developer Enrichment Kits
– 非人类基因组特定区域定制以及超大区域的人类基因组
– 小区域 <30Mb, 中等区域 30-60Mb, 大区域 60-90Mb, 以及超大区域 90-210Mb均可设计
4.数据分析