全转录组测序-欧易生物

通过全转录组测序可快速的获取某一条件下组织或细胞中大部分转录本的表达情况。与常规转录组测序相比，全转录组测序可以同时获得mRNA、lncRNA和circRNA三种类型的RNA信息。 1. 全转录组测序和circRNA测序建库区别是什么？
全转录组测序主要通过去除rRNA，构建链特异性文库，测序文库中保留了mRNA、lncRNA和circRNA的信息。circRNA测序在建库过程中去除rRNA和消化去除线性RNA，特异富集circRNA。相对于全转录组测序，circRNA测序建库可以获得更多的circRNA信息。
2. 全转录组测序和circRNA测序这两种方案如何选择？
如果希望通过一次测序，获得更多类型的RNA信息，建议选择全转录组测序。全转录组测序可以获得mRNA、lncRNA、circRNA三种类型的RNA信息。但由于建库方式的差异和测序数据量的限制，全转录组测序所获得的circRNA类型通常比circRNA测序要少。如果研究目的只关注circRNA，那么建议选择circRNA测序。对circRNA单独测序，通常可以获得比全转录组测序更多的circRNA类型，挖掘出新的circRNA类型。