Reduced Representation Bisulfite Sequencing(RRBS)测序是一种经济的,可实现单碱基分辨的DNA甲基化研究方法。该方法通过酶切DNA特异地富集基因组中的启动子区和CpG岛,实现了低成本的全基因组DNA甲基化谱研究。利用bisulfite处理酶切后的DNA,能够区分未甲基化和甲基化的C碱基,实现单碱基分辨的DNA甲基化分析。
技术优势 - 单碱基分辨:直接读取甲基化和非甲基化的C碱基,可实现单碱基分辨的甲基化分析
- 性价比高:有针对性地检测启动子区和CpG岛,以较低的成本实现全基因组甲基化分析
- 检测范围广:可同时检测全基因组范围内数百万个CpG位点
- 重复性好:特异性酶切处理确保了极高的重复性,多个样本的覆盖区域重复性高达95%,适用于多个样本间的差异甲基化分析
数据分析 基本分析 | 高级分析 |
1. 原始数据整理,过滤和质量评估 | CS-RRB-001. 甲基化基因的GO和信号通路分析 |
2. 序列匹配与数据统计 | CS-RRB-002. 样品间差异甲基化分析 |
3. C碱基的甲基化水平计算 | CS-RRB-003. 差异甲基化基因的GO和信号通路分析 |
4. 甲基化区域的注释,基因组分布统计 | |
数据展示
云序生物技术服务列表1. 测序服务 转录组 | 表观遗传组 | 基因组 |
真核生物 | 原核生物 |
miRNA测序 | 细菌sRNA测序 | (h)MeDIP测序 | 目标序列靶向测序 |
小RNA测序(miRNA, piRNA,siRNA) | 原核生物mRNA测序 | RRBS测序 | 外显子组测序 |
lncRNA测序 | 宏转录组测序 | 全基因组甲基化测序 | 人类基因组重测序 |
环状RNA测序 | 原核生物转录组测序 | ChIP测序 | 16S rDNA测序 |
mRNA测序 | 原核De novo转录组测序 | RNA pull down | 宏基因组测序 |
降解组测序 | | RIP测序 | |
转录组测序 | | RNA甲基化测序 | |
De novo转录组测序 | | | |
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2. 生信服务 & PCR技术服务 生信服务 | 实时定量PCR服务 |
转录组 | 表观遗传组 | 基因组 | 联合分析 |
环状RNA分析 | DNA甲基化分析 | 基因组分析 | circRNA-miRNA | 功能分型PCR芯片 |
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mRNA分析 | | 宏基因组分析 | LncRNA-miRNA-mRNA | LncRNA实时定量PCR |
microRNA分析 | | | | miRNA实时定量PCR |
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