Small RNA是一类长度为18-30 nt,具有调控功能的非编码小RNA的总称。常见的small RNA主要包括:microRNA、siRNA和piRNA等。Small RNA广泛参与包括细胞生长、分化、凋亡在内的几乎所有生理过程,并与包括癌症在内的各种人类疾病相关。
云序生物Small RNA组测序服务可以在一次实验中同时检测所有small RNA,为研究small RNA的功能和调控机制,或者筛选新的small RNA提供了强有力的工具。此外,云序生物还提供仅针对miRNA的测序服务,有效富集miRNA,在相同成本下提高了miRNA有效数据量和测序深度。详情参见miRNA测序服务。
技术优势 - 全物种覆盖:无需预知序列信息,可对任意物种的small RNA组进行检测
- 同时检测miRNA、piRNA和siRNA:在一次实验中同时检测miRNA、piRNA、siRNA和其它small RNA
- 实时更新的small RNA数据库信息:可随时利用ZX的small RNA数据库对数据进行再分析,数据有效
- 灵敏度高:可检测在单个细胞中仅一个拷贝的低丰度small RNA
- 精确度高:可准确区分单碱基差异的small RNA
数据分析 基本分析 | 高级分析 |
1. 数据过滤和接头序列去除 | CS-MIR-001. miRNA靶基因预测 |
2. 序列匹配与数据统计 | CS-MIR-002. miRNA靶基因的GO与信号通路分析 |
3. 已知小RNA(miRNA/siRNA/piRNA)识别,注释和统计 | CS-MIR-003. miRNA-靶基因GO网络分析 |
4. 小RNA表达量计算 | CS-MIR-004. miRNA-靶基因信号通路网络分析 |
5. 差异小RNA筛选 | CS-MIR-005. miRNA上游转录因子分析 |
6. 小RNA表达聚类分析 | CS-MIR-006. 新miRNA预测 |
| CS-MIR-007. miRNA分子标志物筛选 |
数据展示
云序生物技术服务列表1. 测序服务 转录组 | 表观遗传组 | 基因组 |
真核生物 | 原核生物 |
miRNA测序 | 细菌sRNA测序 | (h)MeDIP测序 | 目标序列靶向测序 |
小RNA测序(miRNA, piRNA,siRNA) | 原核生物mRNA测序 | RRBS测序 | 外显子组测序 |
lncRNA测序 | 宏转录组测序 | 全基因组甲基化测序 | 人类基因组重测序 |
环状RNA测序 | 原核生物转录组测序 | ChIP测序 | 16S rDNA测序 |
mRNA测序 | 原核De novo转录组测序 | RNA pull down | 宏基因组测序 |
降解组测序 | | RIP测序 | |
转录组测序 | | RNA甲基化测序 | |
De novo转录组测序 | | | |
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2. 生信服务 & PCR技术服务 生信服务 | 实时定量PCR服务 |
转录组 | 表观遗传组 | 基因组 | 联合分析 |
环状RNA分析 | DNA甲基化分析 | 基因组分析 | circRNA-miRNA | 功能分型PCR芯片 |
lncRNA分析 | ChIP测序分析 | 微生物菌落分析 | LncRNA-mRNA | 环状RNA实时定量PCR |
mRNA分析 | | 宏基因组分析 | LncRNA-miRNA-mRNA | LncRNA实时定量PCR |
microRNA分析 | | | | miRNA实时定量PCR |
| | | | mRNA实时定量PCR |