Argus基因组光学图谱工作站
- 品牌:OpGen
- 型号:Argus
- 供应商:上海吉泰依科赛生物科技有限公司
- 供应商报价:询价
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整合的工作站 | 可进行实验室内外的通讯交流 |
基于卡片形式的分析 | 样品的处理和加工在同一个MapCard上进行 |
试剂盒形式的耗材 | 质量优化的试剂盒让光学图谱制作更简便 |
DNA质量检测 | 大分子量的DNA利用QCard进行质量检测 |
样品类型的多样性 | 多种类型的微生物和微生物混合物都可进行分析 |
简化的工作流程 | 自动的MapCard加工,图像获取和基因组光学图谱的拼接组装 |
库 | 客户可以为自己的研究课题建立数据库 |
文件的输入和转换 | 可以将公共或私人的数据库序列信息转换成计算机模拟的基因组光学图谱进行相应的分析 |
分析软件 | MapSolver软件分析工具 基因组光学图谱可直观的显示、比对和进行亲缘关系分析 显示微生物全基因组特点 显示有序高密度信息数据:发现插入和缺失、重复和反转 可对序列重叠群进行排序和比对 可对序列拼接的准确性进行验证 |
数据分析 | 优化的生物信息学工具——无需专业知识 |
文件格式 | 可兼容.xml和.fasta文件, 图像和数据可以输出至剪贴板或者存储成.csv形式的文件用于将来的分析 |
多种应用 | 比较基因组学,全基因组序列的拼接,菌株分型,亲缘 关系的分析 |
获得光学图谱所需时间 | 初步的基因组光学图谱可以在一个工作日内获得 |
样品制备(3小时内) | 1,从微生物细胞中抽提大分子量的DNA 2,利用QCard对得到的DNA进行分子大小和质量检测 |
程序设定 | 1,在Argus系统管理软件中设定实验名称和参数 2,选择Z适合于实验的限制性内切酶 |
MapCard样品准备和加工 | 1,准备MapCard,加入DNA样品 2,将MapCard放入MapCard加工仪中并加入酶切反应溶液 3,当反应结束后取出MapCard |
数据和图像的获取 | 1,将MapCard放入Argus光学扫描系统中 2,设置成像通道,进行图像获取 3,每个MapCard可以获得多个百万个碱基的DNA分子图像 |
基因组光学图谱的拼接 | 1,获取单个DNA分子限制性内切酶酶切位点图谱 2,制作有序的单个DNA分子限制性内切酶酶切位点图谱 3,构建全基因组光学图谱和输出实验结果数据 |
MapSolver数据分析 | 1,显示有序的全基因组光学图谱 2,鉴别基因组功能元件,注释基因组结构特点, 3,显示计算机模拟光学图谱的序列信息 4,基因组光学图谱间的比对以及基因组光学图谱和计算机 5,模拟的基因组光学图谱的比对 6,辅助序列重叠群的拼接和比对 7,在计算机上保存实验数据或输出数据用于将来的进一步分析 |