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App NGS 表观组测序 RRBS甲基化测序

产品信息
  • 表观组测序 RRBS甲基化测序
    DNA甲基化是重要的表观遗传学标记信息，获得全基因组范围内所有C位点的甲基化水平数据，对于表观遗传学的时空特异性研究具有重要意义。我们以新一代高通量测序平台为基础，结合全基因组Bisulfite处理和生物信息数据分析技术，进行低成本、GX率、高准确度的全基因组DNA甲基化水平图谱绘制。特定物种的高精确度甲基化修饰模式的分析，必将在表观基因组学研究中具有里程碑式的意义，并为细胞分化、组织发育等基础机制研究，以及动植物育种、人类健康与疾病研究奠定基础。
     

     
     
     
     

     

    重亚硫酸盐转换原理

    重亚硫酸盐（HSO3-）可将未甲基化C转换为U，但不能讲甲基化C转变为T。
     

     

    DNA测序技术在重亚硫酸盐处理样本前后对DNA基因组进行测序，经前后序列比对可判别甲基化状态
     

     

     

    技术优势

    精确度高：在其覆盖范围内可达到单碱基分辨率；

    重复性好：多样本的覆盖区域重复性可达到85%-95%，适用于多样本间的差异分析；

    检测范围广：覆盖全基因组范围内超过5百万个CpG位点；

    性价比高：测序区域更有针对性，数据利用率更高
     

    技术服务流程





     

    技术参数

    一、样本要求

    总量：≥ 3 μg DNA（常规样本），≥ 5 μg DNA（FFPE或降解DNA样本）；

    纯度：OD260/280 = 1.8-2.0；

    样品完整性：DNA无明显降解与蛋白污染，需提供凝胶电泳检测胶图；

    适用物种：人和小鼠

     

    二、测序策略： 50 PE。

    三、推荐数据量：3G或5G clean data。

    四、项目执行周期

    单个样品标准流程（上图）的运转周期约为45个工作日。遇样品数较多时，项目周期根据项目规模而定。

    五、合格指标

    产生不低于合同规定的clean data。

     


    BioGenius Basic Analysis基础分析模块
    • DSAM-01 DNA甲基化测序基本数据分析
    • DSAM-02 DNA甲基化区域序列模式分析
    • DSAM-03 DNA甲基化谱差异分析
    • DSAM-04 DNA甲基化的基因组全局染色体分布
     BioGenius Advanced Analysis高级分析模块
    • DSAM-05 DNA甲基化与基因转录表达关联分析
    • DSAM-06 DNA甲基化与siRNA/piRNA调控关联分析
    • DSAM-07 DNA甲基化与正反义链基因关联性分析
    • DSAM-08 CpG甲基化状态的动态性分析
    • DSAM-09 DNA甲基化与染色质组蛋白修饰关联分析
    • DSAM-10 基于DNA甲基化谱构建疾病诊断预测模型
    • DSAM-11 DNA甲基化序列结构基序特征分析

    更多详情：http://www.biogenius.cn/htm/products/rrbs/


     

     

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    • 累计协助客户发表权威SCI论文总IF超过 160分
    • 512核心CPU，1T内存 满足大规模并行的，敏捷的数据分析服务;
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    官方网站：www.biogenius.cn 
    咨询热线：400-016-9606 / 180-1908-2932     
    官方微信： 微信公众平台搜索 “惠研生物”  
    官方QQ： 1744353207 
    咨询邮箱： service@biogenius.cn


     
     


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    • 信息声明：本产品供应信息由仪器网为您整合，供应商为（上海惠研生物科技有限公司），内容包括 （App NGS 表观组测序 RRBS甲基化测序）的品牌、型号、技术参数、详细介绍等；如果您想了解更多关于 （App NGS 表观组测序 RRBS甲基化测序）的信息，请直接联系供应商，给供应商留言！
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