GRSAM-11 免疫组学分析:突变蛋白免疫原性预测(高通量测序数据分析服务)
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基于免疫信息学对免疫原性预测方法的发展,本方案针对全基因组或外显子组测序捕获分析得到的突变基因产物蛋白进行免疫原性预测。利用计算机辅助设计,对潜在突变危害位点的蛋白质做抗原表位预测,包括MHC结合能力预测,MHCI类与II类结合预测,以及B细胞表位预测。
全基因组重测序是Z全面完整获取待研究物种样本基因组结构信息的研究策略。它可以获取全部基因组变异体结构,包括点突变SNP/短插入缺失(indel),基因组重排导致的结构变异(SNV),拷贝数变异(CNV), 杂合性缺失(LOH),重复区段(SD),以及重组热点区域(Recombination Hot spots)等基因组特征和规律。基于精确稳定的Hiseq2500高通量测序平台,凭借多年稳定信息学研究分析经验,惠研生物(BioGenius)可利用基因组测序数据进行重排突变和基因组结构功能分析; 全基因组关联分析与数量性状(QTL)分析;并可整合多方面基因组学数据做关联分析,包括转录组学数据,表观组数据等,可配合比较基因组学,群体遗传学分析技术,进化分析和计算生物学分析方法深入探索感兴趣的科学问题。
全基因组适用于:
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