生物信息学分析服务

服务提供商:上海若谷生物科技有限公司
服务地点：ZG.上海
服务项目：生物信息学分析解决方案
服务简介：上海若谷生物科技有限公司致力于为客户提供专业的生物信息学服务，我们拥有的生物信息工程师和经验丰富的生物统计专家，在新一代测序数据分析、生物统计、芯片数据分析及其他组学数据分析领域有着丰富的实践经验。我们可以根据客户需要完成标准化分析，也可根据客户要求进行个性化生物信息学分析，提供高质GX的数据分析服务解决方案。
分析物种：人、动物、植物、真菌
服务内容：
 

	组学数据分析	基因组	全基因组
			外显子组
			指定区域测序
		转录组	RNA测序
			Mcro-RNA/noncodingRNA/cRNA数据
		表观遗传组	甲基化/Chip-seq
		蛋白组	蛋白质谱数据
		代谢组	质谱、色谱数据
		宏基因组	肠道微生物测序
	芯片数据分析	SNP芯片
		表达谱芯片
		miRNA芯片
		甲基化芯片
	测序数据分析	各类测序数据
	分子网络构建	基因相互作用网络构建
		基因间共表达网络
		基因网络模块分析
		分子修饰分析
		其他分子网络分析
	数据库挖掘	疾病数据挖掘与重分析
		GWAS分析
		META分析
		数据库构建
	系统生物学研究	生物序列中的统计模式识别
		蛋白质结构信息与生物功能
		组学数据整合、分析和软件
		重要生物网络的重建与分析
		复杂疾病的多因素研究
	个性化生物信息分析	根据客户要求定制分析方案
		Pathway crosstalk
		DCGL差异共表达分析
		加权基因共表达网络构建（weighted gene co-expression network, WGCNA）
		miRNA靶基因分析
		转录调控网络分析
		蛋白质互相网络分析
	软件开发	疾病诊断靶点软件
		测序、芯片分析软件
		二级分析软件研发
		临床数据分析软件
	算法还原
	算法开发
	靶点开发	寻找与肿瘤新生抗原疾病预防、诊断、ZL、预后相关的靶点（突变、CNV、修饰、RNA、蛋白、小分子等）	肿瘤致病靶点挖掘分析（新型突变、DNA结构变异、CNV、mRNA、小RNA、lnc/circleRNA、蛋白etc），基于基因组学数据，确定靶点、构建复杂网络关系、建立临床表征关联
			其他疾病致病靶点挖掘分析
	肿瘤新生抗原寻找		肿瘤新生抗原（neoatigen）发现与分析
			肿瘤新生抗原-多肽/抗体对接分析
	药物发现与设计		DNA突变或结构变异后蛋白结构三维重构与结构域分析
			小分子化合物（药物）-靶蛋白分子对接分析 计算机辅助药物筛选/设计（基于NGS、蛋白组数据）中药复杂化合物筛选与药理作用网络构建
			中药FF机理研究
	生物信息培训	高通量测序技术
		不同类型高通量测序技术在医学领域中的应用
		转录组测序数据在疾病研究中的应用
		芯片数据和测序数据类型及其应用
		公共数据库GEO、SRA、ExpressAtlas的介绍和使用
		数据分析实战：差异表达基因分析、DAVID使用、String数据库的使用、Cytoscape使用
		R语言、PERL语言培训
		如何构建疾病研究数理模型
临床新型诊疗模型	临床新型诊疗模型	临床统计学分析	临床试验设计、cox回归、logistical回归、风险模型、机器学习等
		建临床诊疗靶点panel及相关专利开发	机器学习算法构建临床诊疗靶点panel及相关专利开发
统计学	一般数据分析	统计咨询	提供分析思路
		数据整理	让数据符合分析要求，能直接导入分析软件
		描述性统计分析，差异统计	T检验，ANOVA,卡方检验，秩和检验等
		重复测量方差分析、多因素方差分析
		单变量和多变量回归分析	线性或Logistic回归，必要时需要结合临床意义或审稿人要求进行分析
		生存分析：K-M法、Cox回归、寿命表
		诊断性试验分析：ROC曲线
	进阶分析	各类专业图表制作
		多变量与主成分分析
		机器学习和分类
		回归及聚类分析
		临床实验设计与数据分析
		网状meta分析
	统计学培训	临床数据分析常用统计方法
		如何更合理的设计临床实验方案
		系统评价与Meta分析
		R语言在统计学中的应用
		RevMan简介
		Stata应用

服务流程：客户咨询--项目评估--方案设计--合同签订--分析执行--结果审定--出具报告--项目验收
服务周期：根据服务内容不同确定，也可根据客户要求进行商议确定具体时间限。
扩展服务：
              1、提供完整的分析成果演示方案
              2、提供进一步科研基金方案设计与撰写服务
              3、提供相应的生物信息学学术讲座或者技术培训服务
              4、提供后续科研成果发表中所需文稿撰写与投稿支持
              5、提供详细分析报告