SiMax II质粒DNA小量提取试剂盒
- 品牌:赛百盛
- 型号:CSA2-50
- 供应商:北京赛百盛基因技术有限公司
- 供应商报价:¥150
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常见问题 | 可能原因 | 参考意见 | |
质粒产量低 | 细胞裂解不充分 | 减少培养物体积。对于高拷贝质粒,培养物体积不要超过5ml,低拷贝质粒培养物体积不要超过10ml | |
按比例增加溶液I与溶液II的体积,使菌体充分悬浮,然后完全裂解细胞 | |||
非转化细胞的大量生长 | 必须在选择条件下扩增质粒DNA | ||
定量不准确 | 通过琼脂糖凝胶电泳进行观察及定量 | ||
不合适的保存条件 | 将质粒DNA溶于无菌超纯水或TE中,于-20℃保存 | ||
菌液培养的时间过长 | 在新鲜的选择平板上挑选一个分隔良好的单菌落,于37℃振荡培养12~16小时 | ||
质粒的拷贝数太低 | 增加培养物体积,但不要超过10ml | ||
溶液II及结合液有结晶出现 | 将溶液II及结合液置于37℃温浴30min以上,使结晶完全溶解,且在使用前要充分混匀 | ||
洗脱温度过低 | 加入无菌超纯水或者洗脱液浸透硅胶膜后,于37~50℃温育2分钟 | ||
洗脱液pH<7.0 | 用TE或pH>7.0的无菌超纯水洗脱 | ||
洗脱液中没有质粒DNA | 质粒DNA漂出点样孔 | 增加甘油或蔗糖助沉 | |
质粒丢失 | 在新鲜的选择平板上挑选生长良好的单克隆进行细菌培养 | ||
对质粒DNA进行重新转化 | |||
杂菌污染 | 在选择平板上挑选生长正常的菌落进行摇菌 | ||
电泳时质粒呈现额外条带 | 开环质粒DNA及线状质粒DNA的存在 | 加入裂解液后,轻轻混匀,时间不要超过5min | |
可能存在缺失突变体 | 有些质粒如cosmids长期保存于E.coli中是不稳定的,在摇菌时应在选择平板上挑选新鲜的,分隔良好的单克隆 | ||
电泳时质粒呈现额外条带 | 存在质粒多聚体 | 单酶切后,质粒多聚体酶切为线状质粒DNA,可与染色体DNA的污染相区别 | |
存在变性的超螺旋质粒DNA | 加入裂解液(溶液II)后,碱裂解时间不要超过5分钟 |
RNA污染 | 菌体过量,导致RNaseA相对量不足 | 减少培养菌液的体积 |
溶液I放置时间超过6个月 | 于100µl溶液I中加入1µl RNaseA (10mg/ml)或于洗脱液中加入0.5µl RNaseA ,37℃温育30min以上 | |
染色体污染 | 混合操作过于剧烈 | 加入溶液II、溶液III之后,轻柔地颠倒混匀,不要剧烈振荡 |
裂解时间过长 | 裂解时间不要超过5分钟 | |
细菌培养期间,出现细胞裂解 | 菌液的培养时间不要超过12~16小时 | |
质粒DNA降解 | 核酸酶的存在 | 更换菌株,有些菌株,例如HB101、TG1、JM100等含有高水平的核酸内切酶活性 |
使用灭菌的玻璃及塑料制品 | ||
用无菌超纯水或TE洗脱质粒DNA | ||
质粒DNA在下游操作过程中出现问题 | 盐的浓度过高 | 用80%乙醇漂洗质粒DNA |
增加漂洗次数 | ||
缺口质粒DNA的存在 | 减少菌液培养的体积 | |
更换菌株,情况可能会变好 | ||
蛋白质未去除干净 | 检查菌液体积、培养基、菌株生长状况等 | |
增加漂洗液的体积及漂洗次数 | ||
残留有有机试剂 | 增加离心时间,将80%乙醇或异丙醇去除干净 |
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