Small RNA 高通量测序数据分析服务
Small RNA（micro RNAs、siRNAs和 pi RNAs）是生命活动重要的调控因子，在基因表达调控、生物个体发育、代谢及疾病的发生等生理过程中起着重要的作用。通过Illumina Genome Analyzer（Solexa）对small RNA大规模测序分析，可获得物种全基因组水平的miRNA图谱，实现包括新miRNA分子的挖掘，其作用靶基因的预测和鉴定、样品间差异表达分析、miRNAs聚类和表达谱分析等科学应用。
生物信息分析内容
样品经solexa上机测序，通常可获取500万reads以上的Small RNA，可以获取样品全基因组的Small RNA序列，通过生物信息学分析可以从中获得测序样品的全基因组miRNA 图谱，发现新的miRNA 分子，并对其作用的靶基因进行预测和鉴定，进行样品间差异表达分析等科学应用。
基本数据处理：
Ø 图像识别、碱基识别、去除低质量序列（Pipeline）
Ø Small RNA 序列拷贝数计算与去除冗余后的Unique 序列拷贝数计算
Ø 接头序列分析和过滤
Ø Small RNA 的分类注释：
高级生物信息分析内容:
Ø small RNA 长度的分布统计
Ø 与miRNA 数据库进行比对，鉴定已知miRNA
Ø 与测序物种基因组进行比对，并预测新的miRNA
Ø 根据测序物种miRNA 的保守性，对测序得到的miRNA 进行分类
Ø miRNA 差异表达分析
Ø 将预测得到miRNA 定位到基因组，探索其在全基因组的分布特征
Ø miRNA的表达模式聚类分析
Ø miRNA的靶基因预测
深度分析可根据客户需求定制
