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PCR Array of Cell Junction Pathway

产品信息
  • 一、产品介绍:

     

     

     

    Bio qPCR Array专为检测不同组织或细胞中特定基因的表达量而设计,这些基因按照预制或定制要求成套设置。检测结果所显示的表达差异可帮助研究者鉴定或验证这些基因的生物学意义,以及与其研究的重要相关性。

    对于目录(预制)产品,每块384孔板包含84对PCR引物,可以进行4个样本单孔或者两个样本双复的实验。这些引物全部经过预先验证,并包被于指定的板孔中。在同一块96孔板上,有12个(384孔板有48个)反应孔包被了不同类型的对照,用以检测从反转录到qPCR整个过程的反应效率。

    逆转录试剂和以荧光染料SYBR?Green 为基础的定量检测试剂作为被推荐的RT-qPCR试剂产品可与qPCR Array配套使用。该系列试剂均经过优化,具有高的灵敏度、效率和特异性。其他公司的类似试剂可能适用,但未验证过,不推荐使用。

     

    产品优势

     

    Bio QPCR芯片特点:

    灵敏度高,样本使用量低

    线性范围广,可同时检测表达水平差异大的基因

    每个基因的检测引物优化后保证高扩增率和产物单一

    重复性高,Ct值的平均差异只有0.25个循环

    覆盖范围广:目录产品包含通路分析、疾病研究;

    定制产品可根据客户要求选择设置 
    数据分析方便:专用软件方便数据统计与分析

     

    产品说明

     

       

    PCR Array introduction:The Human Cell Junction PathwayFinder RT2 Profiler PCR Array profiles the expression of 84 key genes encoding components of various subcellular macromolecular structures connecting cells to each other or to the extracellular matrix (ECM). Cell junctions include focal adhesions, tight junctions, gap junctions, adherens junctions, desmosomes, and hemidesmosomes, and each one plays a specific role in adhesion, communication, and transduction of mechanical force. Tight junctions seal adjacent epithelial cells together, preventing the passage of most dissolved molecules as well as membrane-bound lipids and proteins between the apical and basolateral epithelial surfaces. Adjacent cells communicate through gap junctions that allow ions and small molecules to pass between their cytoplasms. Adherens junctions and desmosomes form around cadherin-mediated cell–cell contacts, while focal adhesions and hemidesmosomes form around integrin-mediated cell–ECM contacts. Adherens junctions and focal adhesions connect the intracellular domains of their cell surface receptors to actin filaments, while the desmosomes and hemidesmosomes connect to intermediate filaments. Although specific cell junctions predominate in certain cell types, all cells interact with their environment via more than one or even all of these junctions. Analyzing the expression of junction components can help determine their relative importance to the biology of the cellular or disease processes under study. Follow-up studies with arrays specific to the relevant junctions can then further explore the junctions’ roles in cell biology. Using real-time PCR, research studies can easily and reliably analyze the expression of a focused panel of genes involved in cell-cell and cell-ECM junctions with this array.

     

     

     

    二.运输和储存条件:

     

    4度运输。

    -20°C储存至少6个月;

     

     

    三.适用仪器:

     

    lifetechnoliges(原ABI) 7900, Viaa 7 等可使用384微孔板的QPCR 仪器。

    也可以定制其他机器形式:

    Biotnt 可提供多种与以下qPCR仪器匹配的qPCR array类型。

    重要提示:在订购前,请根据您的qPCR仪器型号选购合适的array类型;在收到产品后,请及时确认收到的array是否与您的qPCR仪器匹配。如果您的仪器类型不在下表所列类型中,请及时联系本公司技术支持咨询。

     

    plate format

    Instrument provider

    QPCR instrument model

    A(384well)

    lifetechnologies

    7900,ViiA7(384 well block)

    B(96 well)

    lifetechnologies

    7300,7500,7700,7900(standard 96well),ViiA7(standard 96well)

    C(96 well)

    lifetechnologies

    7500(fast block),7900HT(fast block),stepone plus,ViiA 7(Fast block)

    D(96 well)

    Biorad

    iCycler,MyiQ, iQ5

    E(96 well)

    Biorad

    CFX96,DNA Engine opticon,opticon 2,Chromo4

     

    四.质量标准(QC

     

    1. biotnt gene qPCR array中检测的基因引物,经实验验证结果分析,融解曲线均呈单一锐锋,电泳条带均呈单一条带,说明这些引物均是特异扩增引物,验证合格。

    2. PTC(阳性对照)反应孔,从融解曲线上分析均呈单一锐锋,从扩增曲线上分析,CT值介于18~22之间。

    3. RTC(spike-in反转录对照)反应孔,从融解曲线上分析均呈单一锐锋,从扩增曲线上分析,CT值介于17~23之间。

    4. HGDC 的CT 值应大于35,说明样本中没有基因组污染。

    5. RTC和 PTC的三重复CT 值应比较接近,说明实验重复性好。

    6. 板与板之间(批内)重复性达0.99以上,具有高度重复性。

     

     

    五.基因(引物)排布 :

    每一个样本区里的基因排列如下:

     

     

    1

    2

    3

    4

    5

    6

    7

    8

    9

    10

    11

    12

    A

    基因1

    基因2

    基因3

    基因4

    基因5

    基因6

    基因7

    基因8

    基因9

    基因10

    基因11

    基因12

    B

    基因13

    基因14

    基因15

    基因16

    基因17

    基因18

    基因19

    基因20

    基因21

    基因22

    基因23

    基因24

    C

    基因25

    基因26

    基因27

    基因28

    基因29

    基因30

    基因31

    基因32

    基因33

    基因34

    基因35

    基因36

    D

    基因37

    基因38

    基因39

    基因40

    基因41

    基因42

    基因43

    基因44

    基因45

    基因46

    基因47

    基因48

    E

    基因49

    基因50

    基因51

    基因52

    基因53

    基因54

    基因55

    基因56

    基因57

    基因58

    基因59

    基因60

    F

    基因61

    基因62

    基因63

    基因64

    基因65

    基因66

    基因67

    基因68

    基因69

    基因70

    基因71

    基因72

    G

    基因73

    基因74

    基因75

    基因76

    基因77

    基因78

    基因79

    基因80

    基因81

    基因82

    基因83

    基因84

    H

    HK1

    HK2

    HK3

    GDC

    GDC

    GDC

    RTC

    RTC

    RTC

    PTC

    PTC

    PTC

     

    & 基因引物:84个反应孔(从A排到G排)已预先交联好特异基因引物(详见基因引物列表)。

    HK1-3:3条已交联的管家基因(内参)引物,可作为array数据标准化过程中样品的阳性对照。

    &GDC:基因组DNA对照,可用于qPCR反应体系中是否有基因组DNA污染。

    RTC:spike-in反转录对照,可用于检测RT反应的效率。这些已交联的引物可特异性扩增样品中外源性spike-in RNA反转录形成的cDNA模板。

    PTC:阳性PCR对照,已交联DNA阳性质粒模板,主要用于实时监测array反应板的PCR扩增效率。

     

     

    基因信息列表

     

      Symbol GeneBank
    基因1  CAV1  NM_001753
    基因2  CAV2  NM_001233
    基因3  CAV3  NM_001234
    基因4  CDH1  NM_004360
    基因5  CDH2  NM_001792
    基因6  CLDN1  NM_021101
    基因7  CLDN10  NM_182848
    基因8  CLDN11  NM_005602
    基因9  CLDN12  NM_012129
    基因10  CLDN14  NM_144492
    基因11  CLDN15  NM_014343
    基因12  CLDN16  NM_006580
    基因13  CLDN17  NM_012131
    基因14  CLDN18  NM_016369
    基因15  CLDN19  NM_148960
    基因16  CLDN2  NM_020384
    基因17  CLDN3  NM_001306
    基因18  CLDN4  NM_001305
    基因19  CLDN5  NM_003277
    基因20  CLDN6  NM_021195
    基因21  CLDN7  NM_001307
    基因22  CLDN8  NM_199328
    基因23  CLDN9  NM_020982
    基因24  DLL1  NM_005618
    基因25  DSC1  NM_004948
    基因26  DSC2  NM_004949
    基因27  DSC3  NM_001941
    基因28  DSG1  NM_001942
    基因29  DSG2  NM_001943
    基因30  DSG3  NM_001944
    基因31  DSG4  NM_177986
    基因32  DSP  NM_004415
    基因33  DST  NM_015548
    基因34  ESAM  NM_138961
    基因35  F11R  NM_016946
    基因36  GJA1  NM_000165
    基因37  GJA3  NM_021954
    基因38  GJA4  NM_002060
    基因39  GJA5  NM_181703
    基因40  GJA8  NM_005267
    基因41  GJB1  NM_000166
    基因42  GJB2  NM_004004
    基因43  GJB3  NM_024009
    基因44  GJB4  NM_153212
    基因45  GJB5  NM_005268
    基因46  GJB6  NM_006783
    基因47  GJC2  NM_020435
    基因48  GJD2  NM_020660
    基因49  GJC3  NM_181538
    基因50  ICAM1  NM_000201
    基因51  ICAM2  NM_000873
    基因52  ITGA1  NM_181501
    基因53  ITGA2  NM_002203
    基因54  ITGA3  NM_002204
    基因55  ITGA4  NM_000885
    基因56  ITGA5  NM_002205
    基因57  ITGA6  NM_000210
    基因58  ITGA7  NM_002206
    基因59  ITGA8  NM_003638
    基因60  ITGA9  NM_002207
    基因61  ITGAL  NM_002209
    基因62  ITGAM  NM_000632
    基因63  ITGAV  NM_002210
    基因64  ITGB1  NM_002211
    基因65  ITGB2  NM_000211
    基因66  ITGB3  NM_000212
    基因67  ITGB4  NM_000213
    基因68  ITGB5  NM_002213
    基因69  ITGB6  NM_000888
    基因70  JAM2  NM_021219
    基因71  JAM3  NM_032801
    基因72  JUP  NM_002230
    基因73  NOTCH1  NM_017617
    基因74  NOTCH2  NM_024408
    基因75  NOTCH3  NM_000435
    基因76  NOTCH4  NM_004557
    基因77  OCLN  NM_002538
    基因78  PLEC  NM_000445
    基因79  PVRL1  NM_002855
    基因80  PVRL2  NM_002856
    基因81  PVRL3  NM_015480
    基因82  TJP1  NM_175610
    基因83  TJP2  NM_004817
    基因84  TJP3  NM_014428
     
    温馨提示:不可用于临床ZL。
  • 信息声明:本产品供应信息由仪器网为您整合,供应商为(上海冠泰生物科技有限公司),内容包括 (PCR Array of Cell Junction Pathway)的品牌、型号、技术参数、详细介绍等;如果您想了解更多关于 (PCR Array of Cell Junction Pathway)的信息,请直接联系供应商,给供应商留言!
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