miRNA测序

一、服务介绍

microRNA(miRNA)是一种大小约21—23个碱基的单链小分子RNA，是由具有发夹结构的约70-90个碱基大小的单链RNA前体经过Dicer酶加工后生成，不同于siRNA（双链）但是和siRNA密切相关。microRNA通过和靶基因mRNA碱基配对引导沉默复合体（RISC）降解mRNA或YZmRNA的翻译，从而在转录后水平调控蛋白表达（发现miRNA也能在转录水平调控基因表达）。miRNA在物种进化中相当保守，在动物、植物和真菌等中发现的miRNA表达均有严格的组织特异性和时序性。miRNA在细胞生长和发育过程中起多种作用，包括调控发育、分化、凋亡和增殖等。

目前研究miRNA的方法主要是realtime-PCR、生物芯片技术以及第二代测序技术。基于第二代测序技术的miRNA测序，可以一次获得数百万条miRNA序列，能够快速鉴定出不同组织、不同发育阶段、不同疾病状态下已知和未知的miRNA及其表达差异，为研究miRNA对细胞进程的作用及其生物学影响提供了有力工具。

二、分析项目

标准分析项目

1) 原始数据质控（去接头污染，去低质量reads），数据产出统计；

2) 与参考序列比对；

3) 小RNA与rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA、piRNA的比对信息；

4) 小RNA与miRBase 中指定范围的已知的 miRNA的比对；

5) 按照优先级将小RNA进行分类注释；

6) 预测新的miRNA；

7) 差异miRNA分析；

8) 差异miRNA表达聚类分析；

9) miRNA靶基因预测分析

10) 靶基因功能富集分析

 

高级分析项目（以下分析选择分析结果较好的3~5个）

靶基因蛋白互作网络分析

miRNA功能协同网络分析

miRNA通路协同网络分析

miRNA共调控网络分析

miRNA活性分析

按照客户要求对兴趣miRNA进行深入分析；

重要miRNA的功能富集分析；

三、样本要求

RNA样品总量: ≥3μg

RNA样品浓度: ≥200 ng/μL

四、项目周期

45个工作日