1、技术介绍
NGS可以获得大量的测序数据但是由于读长较短,无法直观的看到整个基因组范围的结构变化,而且由于基因组的复杂性(重复序列和结构变异)限制了基因组的重构和对功能原件的理解。因此迫切需要针对更长片段的分析方法。BioNano公司利用其专利的芯片技术开发的Irys系统可以对长链DNA单分子成像,在更短时间提供更完整的基因组光学图谱。
Irys系统特点 1. 长链DNA分子 — 可检测长达几百kb的长链DNA分子,很好解决重复序列和可变区对研究带来的影响。
2. 高质量的数据 — 单分子DNA通过纳米通道被拉直平行排列,利用高质量图像使基因组结构展现无遗。
3. 应用灵活 — 开放性的平台适合研究人员进行多个领域的研究,尤其在de novo和染色体结构变异方面提供了全新的研究方法。
晶能优势1) BioNano公司的Irys平台,有着通量大,准确性高等特点,在光学图谱质量和性价比上高于其他光学图谱类平台。
2) 已完成多项动植物光学图谱构建,有着丰富的辅助NGS数据再拼接的实验和数据分析经验
2、技术路线
3、样品要求
1) 样品浓度:浓度40ng/µl~200ng/µl。
2) 样品总量:每个样品总量不少于10µg。
3) 样品溶剂:基因组完整(大于等于150kb)、无污染。
4) 样品运输:DNA低温运输(4℃);且在运输过程中请用parafilm将管口密封以防出现污染