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circRNA(环状RNA)测序分析服务

产品信息
  • 应用范围
    1. 对细胞、组织中的全部circRNA进行鉴定和定量;
    2. 发掘新的circRNA,并进行序列分析和功能预测;
    3. 针对circRNA的host gene进行GO、Pathway和其他定制化分析;
    4. 联合miRNA、mRNA进行深入挖掘。
     
    烈冰技术优势
    1. 烈冰科技深度优化circRNA实验建库流程,优化后的去核糖体建库方法可以获得全部mRNA、circRNA和lncRNA,保证用户信息全面;
    2. 助力发表国内首篇circRNA高通量测序高分文献,结合烈冰科技多年的生物信息分析体系,针对不同生物学问题提供定制化分析方案设计;
    3. 烈冰科技采用算法预测新的circRNA,验证率高达80%,并能预测新circRNA功能;
    4. 提供miRNA、mRNA联合分析,进行深入数据挖掘;
     
    实验流程

     
     
    分析流程

     
    结果展示
    circRNA序列分析——基因组位置

     
    ceRNA分析

     
    Co-Expression

     
    WGCNA功能预测

     
     
    发表文献1.       Zheng Q, et al. Circular RNA profiling reveals an abundant circHIPK3 that regulates cell growth by sponging multiple miRNAs. Nat Commun. 2016 Apr 6;7:11215.2.       Liu Q, et al. Circular RNA Related to the Chondrocyte ECM Regulates MMP13 Expression by Functioning as a MiR-136 Sponge in Human Cartilage Degradation. Sci Rep. 2016 Mar 2;6:22572. 
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