简介:扩增子测序是对特定长度的PCR产物或者捕获的片段进行测序,分析序列中的变异。扩增子测序能够根据不同需求,对目标区域进行高覆盖度的测序,还可以检测到低频突变。
推荐平台:Illumina MiSeq
1. 原始数据整理、过滤及质量评估
2. 序列比对与分析
与参考序列比对
SNPs和InDel的检测
3.根据客户需求进行个性化分析
1. 样品纯度要求: OD值应在1.8至2.0之间;电泳检测无明显非特异性杂带,PCR产物条带清晰、完整,混合PCR产物之间的长度差别不多于100bp。
2. 样品浓度:纯化后PCR产物浓度不低于10ng/ul。
3. 样品总量:样品总量不低于500ng。
4. 送样管务必标清样品编号,管口使用Parafilm膜密封。仔细填写DNA样品信息表,提供DNA样品具体浓度、体积、制备时间、溶剂名称及物种来源。同时附上QC数据,包括电泳胶图、分光光度或Nanodrop仪器检测数据。如需进行多次样品制备,需要提供多次样品制备所需样品。
5. 寄送样品需要保持低温环境,Z好的方法是冻干邮寄,其次是溶于TE,当然也可以溶于双蒸水。
派森诺生物拥有多个高端测序平台,其中Illumina Miseq平台读长长,速度快,灵活性强,尤其适合于扩增子测序,可以保证数据的准确性以及变异位点的发现。