JZDNA甲基化和羟甲基化测序(oxBS-seq)
- 型号:oxBS-seq
- 供应商:深圳市易基因科技有限公司
- 供应商报价:¥1
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OXBS(JZ甲基化和羟甲基化测序)
服务名称: JZ甲基化和羟甲基化测序(OXBS)科研服务
随着研究的深入,发现之前被认为是检测甲基化“金标准”的重亚硫酸盐测序并不能区分DNA甲基化(5mc)和DNA羟甲基化(5hmc),测得的甲基化水平实际上是5mC 和5hmC 两种修饰的混合信号。
原理:
先将5hmC 氧化为甲酰基修饰(5fC),5fC可以被重亚硫酸盐转换为碱基T,从而排除了5hmC 的干扰,实现DNA 甲基化的JZ检测。对于脑细胞及干细胞的甲基化研究尤其重要。
单独进行OXBS-Seq,可以得到JZ的甲基化图谱;
同时对样本进行BS-Seq和OXBS-Seq测序,可同时得到JZ的甲基化谱和羟甲基化图谱;
技术优势:
分析内容:
送样要求:
样品要求:无污染、无降解(需提供凝胶电泳检测胶图)
DNA送样量:每个样品基因组DNA不低于4ug。
样品浓度:≥30ng/uL
样品纯度:OD260/280=1.8~2.0
周期:15个样本以下标准运转周期为45个工作日,大样本量项目需分批建库,项目周期需要与技术人员确定。
研究案例:
5mc和5hmc在小鼠胚胎干细胞基因组不同元件的百分量
易基因其他产品列表:
表 观 基 因 组 学 | BS类 | IP类 | 染色质类 | 转 录 组 学 | sc RNA | 微 生 物 组 学 | Meta | 多 组 学 分 析 | scWGBS+scRNA |
WGBS | MeDIP | ATAC-seq | lncRNA | 扩 增 子 测 序 | LHC-BS+ssRNA | ||||
scWGBS | hMeDIP | 原核转录组 | |||||||
RRBS/dRRBS | CHIP | 有/无参考基因组 | |||||||
oxBS | 6mA | ceRNA | |||||||
ACE-seq | m6A | ||||||||
LHC-BS |