非编码RNA（ncRNA）过去常常被认为是不重要的“垃圾DNA”，但随着近年来研究的不断深入，科学家们发现非编码RNA事实上在细胞功能中扮演许多重要角色，ncRNA的突变或表达异常与许多疾病的发生密切相关。目前，ncRNA研究领域主要包含microRNA(miRNA)和lncRNA(long nocoding RNA)，前者（miRNA）是一类长度约为19-25nt的内源性非编码RNA，他们大多数具有高度序列保守性、表达时序性和组织特异性，参与各种各样的调节途径。后者（lncRNA、circRNA）是一类长度大于200bp不编码蛋白质的RNA,其发挥功能的方式很广，可以与蛋白、DNA和RNA相互作用，参与多种生物学过程的调控，主要包括基因组表观遗传修饰、调控转录后翻译、发挥ceRNA、增强子RNA作用等，从而对细胞的增殖、分化、迁移、凋亡、免疫等发挥调控作用。中康博生物可为您提供高通量非编码RNA检测服务（lncRNA、circRNA、miRNA）和表达谱（mRNA）检测！
Part1 : lncRNA+mRNA+circRNA+miRNA前体高通量检测 Clariom™ D —— 市面上WY的四合一芯片（lncRNA+mRNA+circRNA+pre-miRNA）
Affymetrix刚刚推出的一款全转录组芯片，它具有全面转录组覆盖，提供更深、更广、更精细的转录组信息检测， 适用于不同来源与性质的样品，包含临床来源的样品，是转化研究性价比很高的工具。仅通过一次实验， 便可准确检测mRNA、lncRNA、circRNA和miRNA四个层面的信息。 Clariom D检测带来全面的覆盖率、稳定的可重复性、深度可执行的RNA标记物。
Clariom D芯片特点
1、基因数量Top: > 13万个基因，54万转录本
2、基因类型Top: 市面上WY的四合一芯片，可检测编码基因、lncRNA、circRNA、miRNA前体
3、探针密度Top: 业界覆盖度，每个基因对应探针超过109个
4、检测深度Top: 探针靶向检测，一次芯片检测基因数大于300G常规测序
5、检测广度Top： 除了常规样品外，可检测血液、石蜡等降解样品，也可检测低至100ng（10个细胞）的微量样品
6、检测速度Top: Z快1周交付结果
Clariom D的检测数量
Clariom D的注释数据库
如下表所示， 这款芯片囊括的经典数据库高达18个， 其中包括mRNA、lncRNA、miRNA和circRNA的多种数据库。
Clariom D的数据分析
作为一款四合一芯片，除了常见的基础分析外，它所涉及的深入分析也非常丰富，可挖掘的信息很多，而我们致力于Affymetrix芯片检测和数据分析8年，为您提供Z专业Z全面的高通量检测分析服务。
部分lncRNA分析demo图：
Part2： miRNA高通量检测许多疾病，包括癌症，往往可以被看做是由基因表达错乱所引起的。据估计，30％以上的编码基因翻译成蛋白质都是由miRNA调控。越来越多的证据也表明，miRNA与信号网络中调控可变剪切事件的长链非编码RNA相互作用，从而影响了凋亡、增殖和分化等细胞过程。所有这一切都可能成为各种疾病（比如癌症）的致病因素。检测这些关键调控节点的变化对于研究差异表达的生物学背景非常重要。miRNA4.0是一个强大的工具，有助于研究非编码RNA的作用及其在发育生理机制中的参与程度。miRNA 4.0——市面上WY的全物种miRNA芯片
Affymetrix miRNA 4.0 芯片全面覆盖Sanger miRBase V20.0数据库，同时检测206个物种的miRNA。同时检测成熟miRNA和miRNA前体（人、小鼠、大鼠），能检测人snoRNA和scaRNA。这是一款WY能同时检测成熟miRNAH和前体miRNA的芯片检测工具。
其中，人、小鼠、大鼠的具体检测参数如下：
除了可检测常见的人、大小鼠miRNA以外，还可以检测其它小物种（斑马鱼，猴，猪，羊，鸡，牛，犬等两百多物种）。
miRNA4.0 芯片优势
• 物种涉及面广：一张芯片可同时检测206个物种的miRNA信息。
• 注释数据：全面覆盖Sanger miRBase V20.0数据库，可同时检测成熟miRNA和miRNA前体（人、小鼠、大鼠），也能检测人snoRNA和scaRNA。
• 高探针覆盖度：每个miRNA至少覆盖有20条探针 ，其中特殊茎环探针可特异性检测pre-miRNA。
• 样品要求低：上样量只需100ng总RNA ，表达丰度低的血浆、血清、体液、外泌体等亦可检测。
miRNA4.0 芯片注释数据库：
Sanger miRBase 20.0数据库收录了来自约40篇新文献报道的3355条新的发夹前体序列和5393条新的成熟体microRNA，miRNA 发夹前体序列已升至 24521 条；成熟 miRNA 序列升至 30424 条。其中新增成熟 miRNA 中，人成熟的 miRNA 增至 2578 条（新增536条），小鼠成熟的 miRNA 增至 1908 条（新增627条），大鼠 miRNA 增至 728 条。其它物种，Gallus gallus [鸡]新增205条, Solanum tuberosum[马铃薯]新增332条，Populus trichocarpa [毛果杨]新增32条，Linum usitatissimum[亚麻]新增124条（亚麻为新增物种）。此外，还新增了一系列物种的miRNA序列，包括Ictalurus punctatus [斑点叉尾鮰]，Branchiostoma belcheri[文昌鱼]，Avicennia marina[白骨’壤]，Prunus persica[碧桃]，Duck enteritis virus [鸭肠炎病毒]等。
服务特色
• 增加 miRNA和mRNA之间的关联分析信息（在annotation file里增加相应的内容）。
• 为客户整合推出miRNA 芯片分析全面解决方案（包括归一化、差异基因筛选、miRNA靶基因预测、 miRNA与靶基因网络图、miRNA-GO Network、miRNA-Pathway Network、miRNA的转录因子的预测、miRNA与表达谱芯片平台的联合分析）。部分miRNA分析demo图：
Part3： mRNA高通量检测（即表达谱检测）1. PrimeViewTM 人类基因表达芯片——高性价比的表达谱芯片
PrimeViewTM人类基因表达芯片提供了高质量的基因表达分析技术，实现了全基因组的基因表达分析。PrimeViewTM是U133 plus 2.0的简化版芯片，它表现出极高的性能、检测信号强以及重复样品的倍数变化关联性好；是一款研究药物和疾病调控机制的强大且经济GX的工具。
PrimeViewTM芯片优势
※ 出色的检测特异性和可重复性；
※ 探针覆盖度高，检测结果可靠（注释明确的序列为每组11个探针，其余每组9个探针）；
※ 全面覆盖已知注释基因组，可检测49395个基因；
※ 性价比高，经济GX。 PrimeViewTM注释数据库来源
| Data sources | PrimeView |
| Unigene | 219 |
| Refseq | 41 |
| NCBI genome version | 37 |
| UCSC | 19 |
| Ensemble | 57 |
| GenBank | 177 |
| Entrez | 6/2010 |
PrimeViewTM 芯片性能
PrimeViewTM芯片表现出与其他3’端表达谱分析芯片同样高水平的性能。CV平均值小于10％。重复样品的皮尔森系数大于0.990。
信号关联：MAQC A（A）,MAQC B（B）和HeLa C（C）平行样品杂交比较后的RMA探针组信号散点图比较后计算Pearson相关系数（R）2. Clariom™ S —— 业界领先的人、大鼠和小鼠基因水平芯片解决方案
Clariom™ S为科研工作者提供Z快、Z便捷以及Z灵活的方式去检测转录组内的基因水平变化（于人类，小鼠和大鼠）。特别设计针对覆盖所有注释明确的基因，兼容不同类型样品包含临床来源样品，多种格式包含单张卡式芯片及高通量板式芯片满足不同样品通量研究需要。Clariom™ S是用于基因生物标志物筛选的快速经济工具，也是研究注释明确基因的Z好工具—简单、高速、低成本。
Clariom™ S芯片优势
※ 准确定量： > 20,000个明确注释基因的基因表达水平检测。
※ 灵活性高：根据需选择适合芯片格式，单张卡式芯片或者高通量板式芯片。
※ 经济GX：价格经济，每天可处理1到192个样本。
※ 分析快捷：专业的分析工具，几分钟内就可完成。
※ 注释明确：针对已知基因都有明确注释，助于提高数据利用率
Clariom™ S探针覆盖情况
| Content summary | Human | Mouse | Rat |
| Gene | >20,800 | > 22,100 | >22,900 |
| Transcripts | >337,100 | >150,300 | >129,800 |
| Total probes | >211,300 | >221,900 | >231,800 |
Clariom™ S注释数据库来源
| Content summary | Human | Mouse | Rat |
| Esemble | >20,000 | >21,700 | >20,500 |
| VEGA | >19,900 | >14,700 | - |
| NONCODE | >12,200 | >9,200 | - |
| lncRNAWiki | >12,200 | - | - |
| UCSC Genes | >19,800 | >21,000 | - |
| AceView | >10,800 | - | >18,000 |
| miTranscriptome | >10 | - | - |
| Refseq | >19,500 | >20,800 | >16,500 |
| MGC | >17,100 | >17,300 | >6,400 |
| MGI | - | >21,300 | - |
| RGD | - | - | >21,700 |
| Consensus CDS | >18,500 | - | - |
| RNA Central | >1,100 | - | - |
| circBase | >11,500 | - | - |
| Human Body Map | >400 | - | - |
| lincRNAdb | >10 | >10 | >2 |
| Publication-specific gene sets | >3000 | - | >8,020 |
| Non-overlapping orthologous mouse gene and transcript models | - | - | >20 |
3. 其他小物种表达谱芯片
Affymetrix 3' IVT Expression Array: 拟南芥、苜蓿、稻、大豆、大麦、小麦、柑橘、棉花、玉米、白杨、甘蔗、西红柿、葡萄、酵母、果蝇、秀丽隐杆线虫、牛、犬、鸡、猪、恒河猴、非洲爪蟾、热带爪蟾、斑马鱼。
Affymetrix Gene 1.0 ST Array : 拟南芥、苜蓿、稻、大豆、果蝇、秀丽隐杆线虫、牛、犬、鸡、猪、恒河猕猴、食蟹猕猴、马、猫、豚鼠、狨猴、羊、兔、恒河猴、斑胸草雀、斑马鱼、番茄。部分mRNA分析demo图：
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北京中康博生物科技有限公司（Beijing Cnkingbio Biotechnology Corporation）位于北京亦庄生物医药园高新科技区，是一家以生物技术服务为主导的创新型高新科技企业，致力于为生命科学研究人员提供GX、可靠的实验解决方案。Cnkingbio拥有四大服务平台：Affymetrix基因芯片检测平台、新一代测序平台、蛋白检测平台、生物信息分析平台，凭借高标准的技术平台和多样化的服务等竞争优势，公司向国内外企业和相关单位提供系统的生物学研究全面解决方案。目前正在为超过500家的国内科研机构、医院等提供基因表达谱、基因分型、微生物检测、DNA甲基化、miRNA、LncRNA、蛋白质谱、分子marker筛选及确认、以及生物信息等科研技术服务。公司拥有一支以北京为基础，辐射全国的强大市场营销队伍和销售网络，科研技术团队有丰富的工作经验，在业界有口碑。过去承接项目数超过1500个，协助客户发表SCI论文70余篇（影响因子共计400多分），全面推动了ZG基因组学服务产业的发展。
资料下载：
小物种芯片参数.pdf
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miRNA芯片单页.pdf
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表达谱芯片单页.pdf
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Clariom D芯片单页.jpg
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