一站式慢病毒稳转细胞株筛选构建
- 型号:上海麒盟生物科技有限公司
- 供应商:麒盟(上海)生物医学有限公司
- 供应商报价:¥5000
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1. 目的基因合成和表达载体构建
1) 目的基因合成
2) 选择合适的表达载体,目的基因合成后直接连接构建
3) 测序验证
2. 表达质粒载体
1) 质粒转化细菌扩增
2) 质粒抽提纯化
3) 酶切电泳以及测序再验证
3. 慢病毒包装
1) 试剂:表达载体、慢病毒载体系统、293T细胞和转染试剂
2) 共孵育及收集含病毒上清液
3) 病毒纯化和浓缩
4) 病毒保存(-80℃)
4. 慢病毒感染目的细胞预实验
1) 优化条件:细胞种板密度、病毒最适MOI、是否需要polybrene辅助感染试剂等
2) 荧光观察或者FACS检测感染效率
5. 药物筛选浓度优化
1) 药物浓度梯度
2) 处理48小时后细胞全部死亡的ZD药物浓度为后续实验拟用浓度
6. 正式实验
1) 慢病毒感染
2) 荧光观察
3) 药物筛选多克隆细胞稳转株(或者FACS分选表达GFP的细胞)
4) 有限稀释单克隆细胞株筛选及扩大培养
7. 鉴定
1) 荧光拍照
2) 目的基因qPCR检测
3) Flag或目的基因表达蛋白的Western blot检测
过表达稳转株 | 基因合成及质粒提取 | 具体价格需要根据目标基因的长度确定,此价格以1500bp为例。 |
病毒包装及预实验 | ||
稳转株筛选 | 筛选出3个单克隆 | |
qPCR和WB鉴定 | 目标基因抗体费用已包含,以小包装2500元计算 |
1. 选择至少3个不同的靶点,设计shRNAs
2. 合成对应的序列并构建表达载体
3. 后续慢病毒感染细胞及筛选,步骤基本与LentiOE-Stable相同
4. 注意事项
1) 单克隆分析前需要筛选出干扰效率ZG的siRNA。经抗药基因初步筛选后,提取RNA以qPCR检测目的基因干扰效率。
2) 筛选出的siRNA再进行单克隆分析,以qPCR检测筛选出干扰率ZG的稳转株,再以WB鉴定选出敲减效果的稳转株。
3) 需关注细胞存活率和生长状态。某些基因敲减会造成生长缓慢或者致死表型,因此药物筛选会有影响,需要将细胞以低密度种板进行单克隆筛选,或者可选择FACS分选表达GFP的细胞再分析。也可选择可诱导型RNAi表达载体。
序列合成及载体构建 | 构建3个不同靶点的shRNA载体 | |
敲减稳转株 | 病毒包装及预实验 | 需要筛选出一个最有效的shRNA载体 |
稳转株筛选 | 筛选出3个单克隆 | |
qPCR和WB鉴定 | 目标基因抗体费用已包含,以小包装2500元计算 |
1. 选择至少3个不同的靶点
2. Cas9载体构建
3. 慢病毒感染及筛选同前
说明:本项实验ZD在于前期序列设计及载体构建。
序列合成及载体构建 | 构建3个不同靶点的载体 | |
Cas9敲除 | 病毒包装及预实验 | 需要筛选出一个最有效的shRNA载体 |
稳转株筛选 | 筛选出3个单克隆 | |
qPCR和WB鉴定 | 目标基因抗体费用已包含,以小包装2500元计算 |
服务项目 | 公司提供 | 交付产物 | 实验 周期 |
慢病毒稳转细胞株构建预实验 | 1、待感染的靶细胞系和培养方法 | 1、GFP对照慢病毒的感染荧光图 2、预实验总结 | 2周 |
基因过表达慢病毒稳转细胞株 (LentiOE-Stable) 基因敲减慢病毒稳转细胞株 (LentiKD-Stable) CRISPR基因敲除慢病毒稳转细胞株 (LentiCas9-Stable) | 1、慢病毒 2、慢病毒滴度信息 3、待感染的靶细胞系和培养方法 4、western-blot的一抗 5、质粒构建 6、DMEM培养基,RPIM1640培养基 | 1、目的稳转细胞株 2、对照稳转细胞株 3、western-blot/qPCR原始结果 4、详细实验报告 | 6-10周 |