Mouse ceRNA/circRNA芯片服务

Mouse ceRNA 芯片v1.0介绍

       非编码RNA因在生命过程中起到非常重要的调控作用而越来越受到重视 ，lncRNA 、circRNA广泛参与了许多疾病的发SF展， 系统地研究生物体内lncRNA 、circRNA 的功能和作用机制，有助于我们更加全面、深入地了解基因表达调控机理及生物体的生命活动。小鼠基因组与人类基因组高度同源，作为复制人类疾病动物模型和研究基因功能的动物，广泛应用于发育生物学、功能基因组学和疾病机制的研究领域。伯豪生物全国首推小鼠三合一芯片，涵盖mRNA、lncRNA、circRNA，让您一次实验就能够全面地分析整个转录组。
 

芯片特点:

• 稳定：芯片采用Agilent eArray平台设计，使用Agilent SurePrint技术合成，探针长60mer，检出率高，技术重复性高于99%；利用芯片碱基互补杂交的方式，能够比测序技术更灵敏、稳定地对表达丰度较低的circRNA、lncRNA进行检测;

• 超值：覆盖circRNA、lncRNA、mRNA。一份芯片数据同时提供三个层面的表达信息，circRNA和lncRNA作为典型的内源竞争性RNA，此款芯片可以让您畅游ceRNA调控研究;

• 高通量：包含41,960条circRNA，86,682条lncRNA、20,783条mRNA，让您的筛选范围更广；针对circRNA伯豪生物筛选、收集大量高水平文献及公共数据中的circRNA ；

• 特异性高：环状RNA -特异的反向剪接位点探针设计，保证每个探针检测的特异性，避免与母基因之间的冗余影响。

探针设计策略示意图

芯片技术参数：

数据来源：

GENCODE /Ensembl(6,094)、lncrnadb (12)、Noncode v5 (80,101)、UCSC /NCBI(21,258)、circbase（9,365）、deepbase（379）、SBC（32,216）。
 

Mouse circRNA 芯片v1.0介绍

       同样采用Agilent eArray平台设计，使用Agilent SurePrint技术合成，探针长60mer，检出率高，技术重复性高于99%；环状RNA -特异的反向剪接位点探针设计，保证每个探针检测的特异性，包含41,960条circRNA。

芯片技术参数：

数据来源：

circbase（9,365）、deepbase（379）、SBC（32,216）。

参考文献：

Rybak-Wolf et al., Circular RNAs in the Mammalian Brain Are Highly Abundant, Conserved, and Dynamically Expressed.2015, Molecular Cell 58, 870–885 June 4.
Memczak S et al., Circular RNAs are a large class of animal RNAs with regulatory potency.Nature. 2013 Mar 21;495(7441):333-8. doi: 10.1038/nature11928. Epub 2013 Feb 27.
Xintian You et al., Neural circular RNAs are derived from synaptic genes and regulated by development and plasticity. Nat Neurosci. 2015 April.
Fan et al., Single-cell RNA-seq transcriptome analysis of linear and circular RNAs in mouse
preimplantation embryos. Genome Biology (2015).