环状RNA（circRNA）是区别于传统线性RNA的一类新型RNA，具有闭合环状结构，大量存在于真核转录组中。大部分的环状RNA是由外显子序列构成，在不同的物种中具有保守性，同时存在组织及不同发育阶段的表达特异性。由于环状RNA对核酸酶不敏感，所以比线性RNA更为稳定，这使得环状RNA在作为新型诊断标记物的开发应用上具有明显优势。近来研究显示，环状RNA在不同物种中起到miRNA海绵的作用，称之为竞争性內源RNA（ceRNA），能竞争性结合miRNA。而与疾病关联性miRNA的相互作用说明环状RNA对疾病的调控起着非常重要的作用。
为了能够更好的研究circRNA，Arraystar开发了市场上DY款circRNA芯片。其circRNA来源融合了环状RNA研究的标志性文献，所有cicrRNA都经过了严谨的实验验证，使得对不同生理及病理条件下的circRNA转录组进行系统研究成为了可能。同时我们对所有的circRNA都用高匹配值的miRNA靶标位点进行了标注，这将有利于对circRNA作为天然miRNA海绵功能的研究。
Arraystar的circRNA芯片目前涵盖了人和小鼠。每一个circRNA对应一个剪接点探针，能准确可靠的检测单一circRNA，即便在对应线性RNA存在的情况下也具有高特异性。随机引物反转标记系统和样品的RNase R预处理确保了circRNA的GX特异性标记。此外，RNA spike-in对照的设置能很好的监控样品标记和芯片杂交效率。
| 康成生物是Arraystar公司ZG地区WY代理商，为您提供一站式circRNA芯片技术服务，您只需要提供保存完好的组织或细胞标本，康成的技术服务人员就可为您完成全部实验操作，并提供完整的实验报告。 |
Arraystar环状RNA芯片产品列表 | 芯片名称 | 芯片 | 描述 |
| NEW Human Circular RNA Array Service | Human Circular RNA Array | 5396 human circular RNAs |
| NEW Mouse Circular RNA Array Service | Mouse Circular RNA Array | 1797 Mouse circular RNAs |
Arraystar环状RNA芯片特点
· 优化的特异性标记流程
能够有效的去除线性RNA，特异性标记circRNA
*图释：环状RNA标记流程：1）RNase R预处理有效地去除线性RNA；2）基于随机引物的反转标记系统有效的标记circRNA。
· 剪接点特异性的探针
能准确可靠的检测circRNA，即便在相应线性RNA存在的情况下也能特异性检测circRNA
*图释：Arraystar 环状RNA芯片采用了针对特异性剪接点的探针。 线性RNA经过不同的方式拼接：外显子A 的5’端和外显子B的3’端连接，形成环状RNA。Arraystar以circRNA特异性拼接位点作为靶标序列，设计芯片探针，即使在相应的线性RNA存在的情况下也可以准确的检测circRNA。
· 详细的circRNA注释
Arraystar miRNA靶基因预测软件对circRNA上的保守miRNA的结合位点进行了预测，并对其中匹配分值较高的位点进行了注释。此外，我们还提供了与circRNA对应的线性mRNA信息。根据信息，客户可以很方便的从miRNA海绵的角度研究circRNA的作用机制和生物功能。
*图释：详细的circRNA注释：1）与circRNA对应的线性mRNA信息；2）circRNA上匹配度比较好的保守miRNA的结合位点。
在RNA样品中加入一组由ERCC (External RNA Controls Consortium)开发的外源性RNA，可以对RNA扩增，标记和芯片杂交过程中产生的实验偏差进行校正。更为准确地判定检测方法的局限性，同时增加样本间结果比较的可靠性。
· 性能保证· 高灵敏度：能准确检测跨域5个数量级的低丰度RNA
· 高重复性：Arraystar circRNA 芯片实验的技术重复组之间具有很好的相关性（R2>0.9）
康成生物环状RNA芯片技术服务主要实验流程
1. 样品RNA抽提 • 实验对象为组织样品，取适量（50-100mg）新鲜组织样品或正确保存的组织样品，加1ml的RNA抽提试剂TRIzol（Invitrogen），匀浆后抽提RNA。
• 实验对象为细胞样品，每份样品取1×10
6～1×10
7细胞，完全吸去培养液后加1ml的RNA抽提试剂TRIzol，裂解后抽提RNA。
2. RNA质量检测 • 使用Nanodrop测定RNA 在分光光度计260nm、280nm和230nm的吸收值，以计算浓度并评估纯度。
• 用甲醛电泳试剂进行变性琼脂糖凝胶电泳，检测RNA纯度及完整性。
• 提供RNA QC报告。
3. RNase R处理
4. cDNA/aRNA样品合成和标记
5. 标记效率质量检测 • 使用Nanodrop检测荧光标记效率，标记效率合格以保证后续芯片实验结果的可靠性。
6. 芯片杂交 • 在标准条件下将标记好的探针和高密度基因组芯片进行杂交。
7. 图像采集和数据分析 • 使用GenePix 4000B芯片扫描仪扫描芯片的荧光强度，并将实验结果转换成数字型数据保存，使用配套软件对原始数据进行分析运算。
8. 提供实验报告： • Scanning Image: Cy3荧光扫描图像；
• Scatter Plot: 散点图，X轴为Control信号值，Y轴为Experiment信号值，表示信号数据总体分布趋势；
• Raw Data: 探针的扫描荧光信号强度原始数据；
• Normalized Data: 经过统计学方法标准化后数值；
• P–value: T-test统计分析显著差异表达的基因，p-value越小，该circRNA在两组样本间差异表达越显著；
• Significant Up & Down Regulated CircRNA List: 显著差异表达的circRNA列表包含Fold Change, p-value以及circRNA的详细注释信息（相应的线性mRNA和miRNA结合位点）。
上海康成生物工程有限公司
地址：上海市宜山路700号C2栋3楼（200233）免费热线：400-886-5058；800-820-5058
电话：021-64451989
传真：021-64452021
www.aksomics.com
