DNA甲基化测序RRBS

Reduced Representation Bisulfite Sequencing（RRBS）是一种准确、GX、经济的DNA甲基化研究方法，通过酶切富集启动子及CpG岛区域，并进行Bisulfite测序，同时实现DNA甲基化状态检测的高分辨率和测序数据的高利用率。DNA甲基化研究一直是疾病研究的热点，与基因表达、表型性状息息相关。RRBS作为一种高性价比的甲基化研究方法，在大规模临床样本的研究中具有广泛的应用前景。
技术优势
·         精确度高：在其覆盖范围内可达到单碱基分辨率；
·         重复性好：多样本的覆盖区域重复性可达到85%-95%，适用于多样本间的差异分析；
·         检测范围广：覆盖全基因组范围内超过5百万个CpG位点；
·         性价比高：测序区域更有针对性，数据利用率更高。
研究结果充分证明了RRBS技术的可靠性。RRBS可作为一种更GX经济的研究方法，可应用于检测全基因组启动子和CpG岛区域DNA甲基化状态。

分析内容
1. 数据产出统计：对测序结果进行图像识别、去污染、去接头，统计结果包括read长度、read数据、数据产量;
2. RRBS序列与参考序列的比对；
3. Promoter和CpG岛（CGI）覆盖度分析；
4. Promoter和CGI区甲基化分析；
5. 差异性甲基化区域（DMR）分析。
参考文献
[1] Wang L, Sun J, Wu H, et al. Systematic assessment of reduced representation bisulfite sequencing to human blood samples: A promising method for large-sample-scale epigenomic studies. J Biotechnol. 2012.
[2] Li S, chowdhry, Liu F et al.  Tumor-Suppressive miR148a Is Silenced by CpG Island Hypermethylation in IDH1-Mutant Gliomas. Clin Cancer Res. 2014.
[3] Terragni J, Zhang G, Sun Z, et al. Notch signaling genes: myogenic DNA hypomethylation and 5-hydroxymethylcytosine. Epigenetics, 2014.