高通量测序——分子生态学研究

微生物分子生态学是利用分子生物学手段研究自然界微生物与生物及非生物环境之间相互关系及其相互作用规律的科学，其研究方法包括PCR克隆文库、Geochip芯片分析和第二代高通量测序等。
 
研究内容
■16s/18s rDNA的不同可变区测序
■各种环境的菌群结构分析
 
翰宇优势
■翰宇独有的dual-barcode技术，在单个Miseq反应中完成高达1000个样本的混合测序
■每个样品可获得数千条序列，有效获得样本中低丰度的细菌
 
技术路线

 
生物信息学分析

结果示例
稀释曲线
 

菌群分类


PCA分析                             


系统发育

 
成功案例 
■ 环境微生物分子生态学：包括海洋浮游微生物、生态学鉴定（16s+ITS）、深海微生物、土壤微生物、粪便微生物、堆肥中微生物、游泳池、酒窖、厌氧发酵池等
■人体微生物分子生态学：口腔、肠道、皮肤、鼻内微生物等