二代测序数据生物信息学分析

服务提供商:上海若谷生物科技有限公司
服务地点：ZG.上海
服务项目：二代测序数据的生物信息学分析
服务简介：上海若谷生物科技有限公司致力于为客户提供专业的生物信息学服务，我们拥有的生物信息工程师和经验丰富的生物统计专家，在新一代测序数据分析、生物统计、芯片数据分析及其他组学数据分析领域有着丰富的实践经验。我们可以根据客户需要完成标准化数据分析，也可根据客户要求进行个性化生物信息学分析，提供高质GX的数据分析服务解决方案。
分析物种：人、动物、植物、真菌
服务内容：
         1、二代测序数据预处理
         2、热点生物信息学分析
            1)小RNA数据分析
            2)转录组数据分析 
            3)微生物基因组分析 
            4)基因数字表达谱DGE分析
            5）外显子组数据分析
            6）全基因组数据分析
         3. 基因组学相关分析
            1)序列拼接，基因组组装。
            2)序列比对，同源性搜索、物种同源分析。
            3)多序列全局比对，同源进化树构建及进化分析。
            4)EST的基因组定位，可变剪切形式确定 。
            5)Promoters预测与查找，CpG岛，调控元件预测等。
            6)重复序列注释：SSR, STR, LINE, SINE, Transposons等。
            7)基因预测及基因结构分析：真核，原核，mRNA/cDNA编码区预测。
            8)Non-Coding RNA的预测与注释：
                tRNA预测及二级结构分析
                rRNA预测
                MiRNA预测及结合靶点预测
                soRNA预测及甲基化位点预测
           9)SNP分析。
          10)分子进化相关分析：分歧年代，进化树，进化压力（Ka, Ks）。
          11) EST序列/一般序列分析
              序列基本分析：去除载体，污染，聚类，拼接
              表达谱分析：特异表达基因，共调控基因
              Unigene的功能注释及分类
              基于EST的SNP分析
         12)基因的功能注释及分类
服务流程：客户咨询--项目评估--方案设计--合同签订--分析执行--结果审定--出具报告--项目验收
服务周期：根据服务内容不同确定，也可根据客户要求进行商议确定具体时间限。
扩展服务：
         1、提供完整的分析成果演示方案
         2、提供进一步科研基金方案设计与撰写服务
         3、提供相应的生物信息学学术讲座或者技术培训服务
         4、提供后续科研成果发表中所需文稿撰写与投稿支持
         5、提供详细分析报告
联系方式：高经理（运营经理）
          15618935729