简化基因组测序
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产品库
服务简介
简化基因组测序（Reduced-Representation Genome Sequencing）是一种针对全基因组特定酶切位点附近区域进行高通量测序技术。它不仅实验操作简单，性价比高，更为重要的是它不依赖参考基因组信息，一次测序即可获得数以万计的多态性遗传标记，已广泛用于生态学、遗传进化、传统基因组学等研究领域。
服务详情
实验流程
RAD：限制性酶单酶切+机械打断建库测序，RAD其实就是特异性内切酶两个识别位点之间的一段DNA片段；
GBS（genotyping by sequencing）：常见酶单酶切+PCR选择性扩增短片段序列建库测序；
目前Z为常用的简化基因组测序技术主要有RAD和GBS以及其衍生的dd-RAD和2b-RAD。
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样品要求
（1）样品要求
a. 样品类型：DNA 样品、无降解或轻微降解、无污染。
b. 样品需求量：≥1ug；ddRAD-Seq 样品需求量 0.5ug。
c. 样品浓度：≥25 ng/μl；
d. 建议提交样品数量：遗传图谱构建>100；群体进化>30。
（2）注意事项
a. RAD-Seq 对样品定量准确性要求很高，直接影响样品间的数据分布。同时多糖、蛋白或高浓度离子也会影响酶切效果，可能导致数据不均。
b. 建议尽可能提供同一批次的基因组 DNA 样品，以免因不同批次提取效果不一而导致酶切效果不均。
c. 务必用 RNase 酶处理基因组 DNA 样品（特别是植物样品），以免影响样品定量的准确性。
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交付结果
基于简化基因组测序可以进行群体进化、全基因组关联分析（GWAS）、遗传图谱及 QTL 定位 等方向的分析，具体的分析方案与报价可讨论后确定。
