提供基因芯片数据分析服务-生物信息学分析，信号转导，疾病分子靶点等

生物芯片信息学服务

基因芯片和生物信息学分析

                                                                                             

 

基因信号转导通路分析，差异基因表达谱分析，差异miRNA表达谱分析. T-检验，F方差检验，数据相关性检验，数据稳定性检验，数据批间随机误差消除，变异系数校正，绘制Cluster图谱等：

信号转导通路分析（Pathway Analysis)：

信号转导通路富集分析

 

KEGG信号转导通路

 

 

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基因功能（GO）分析：

基因功能富集度分析，基因集（Gene Set ）富集分析: 信号转导通路富集分析，凋亡分化相关基因富集等。

基因功能富集度分析（GO Analysis）：芯片数据结果示例图

 

《Nature》杂志上的基因功能富集度分析图：

《Nature》参考文献：An embryonic stem cell-like gene expression signature in poorly differentiated aggressive human tumors.Ben-Porath I, Thomson MW, Carey VJ, Ge R, Bell GW, Regev A, Weinberg RA.Nat Genet. 2008 May;40(5):499-507.

 

基因集（Gene Set)分析图：

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精美的热图，Cluster图制作，Cluster筛选分子标志物

 

 

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SNP 位点分析: 

特定疾病SNP位点筛选, 特定信号转导通路SNP位点筛选，基因芯片SNP位点定制预筛选 (从百万SNP 位点中筛选出特定生物学含义或疾病机制相关的SNP位点)，基因或疾病与SNP的关系分析等。

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基因/DNA甲基化（ Methylation）分析示例：

 

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MicroRNA 靶点预测，miRNA 信号通路分析，新发现miRNA的靶点基因预测

 

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基因芯片数据标准化：

基因芯片数据标准化（标准化方法：Average，Quantile，Cubic Spline，Rank Invariant），T-检验， 方差分析F-检验，样本显著性差异统计，多样本组间差异分析，假阳性/随机误差点统计消除等。

 

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探针设计：

 

染色体特异性荧光探针设计，如：针对大鼠18号染色体设计特异性识别的荧光探针，可以检测18号染色体在核内的位置。

药物靶点筛选

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FDA 药物的作用靶点以及它们与疾病的关系

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激酶的作用底物，位点，序列分析

 

 

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Peptidase Target/Substrate Analysis 蛋白酶的作用底物，水解位点、方式等分析

 

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受体KiYZ常数分析

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药物和疾病相关分析

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FDA 药物与疾病的关系

 

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各种化合物的作用靶点和信号转导通路

 

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药物-疾病关联性分析