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ChIP实时定量PCR技术服务

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    ChIP-qPCR结合了ChIP技术和实时定量PCR技术。ChIP技术利用抗体特异性富集与特定转录因子/组蛋白修饰结合的DNA片段;qPCR 技术使用SYBR荧光染料,非特异性的掺入DNA双链,发射荧光,保证荧光信号的增加与PCR产物的增加完全同步,利用Ct值进行定量分析。 ChIP-qPCR能够专一,灵敏,快速,高重复地定量生物样品中特定转录因子/组蛋白修饰与已知基因启动子的结合。
     
    虹舜生物为您提供ChIP-qPCR技术服务,您只需要提供保存完好的标本及标本信息,虹舜生物就可为您完成全部实验操作,包括超声打断基因 组、染色质免疫共沉淀、IP Input DNA片段线性扩增、图像采集和数据分析,提供给您完整的实验报告.
     
     
     
     
     
     
     

    ChIP-qPCR技术特点
        · 高特异性,针对感兴趣的基因启动子设计特异性的实时荧光定量PCR引物;
        · 超宽的线性范围,可跨越7个数量级;
        · 精确度高,重复性好;
        · 灵敏度高
     
    ChIP-qPCR技术服务流程:
        A. 样品交联,甲醛处理细胞,交联DNA与DNA结合蛋白
        B. 超声打断染色质,裂解细胞,并以超声波将染色质打断成400-500bp的片段
        C. 染色质免疫共沉淀,将B所得片段分成两份,一份与特异性抗体进行免疫共沉淀(ChIP),另一份作为Total input样品
        D. DNA纯化,将C所得两份蛋白-DNA复合物解交联,纯化分离DNA片段。ChIP富集的DNA片段(ChIP DNA),Total input样品中的DNA片段(Total input DNA)
    E. 实时荧光定量PCR检测

     
    F.实验数据处理
      ● Total input DNA样品作为模板,用待测基因特异性引物进行qPCR,检测得到Ct值(Input)
      ● ChIP DNA样品作为模板,用待测基因特异性引物进行qPCR,检测得到Ct值(ChIP)
      ● 待测基因免疫共沉淀的效率(ChIP / Total input)可通过以下公式计算:
        %(ChIP / Total input) = 2^[ Ct (Input)- Ct (ChIP) ] * 100
     
    ChIP-qPCR样品准备:
    悬浮细胞:
    1. 取107悬浮细胞低速离心,用10ml培养基将细胞沉淀重悬于50ml离心管中;
    2. 加入270ul 37%的甲醛,轻轻混匀,室温孵育10分钟;该步骤Z好在通风橱中完成;
    3. 加入1ml 1.25M的苷氨酸,轻轻混匀,室温孵育5分钟,中和甲醛;
    4. 2000×g离心5分钟,弃上清,用预冷的1×PBS/EDTA洗细胞两遍;
    5. 2000×g离心5分钟,弃上清;
    6. 收集到的样品-80℃冻存,干冰运输
    贴壁细胞:
    1. 将10cm培养皿中(107细胞)旧的培养基吸掉,添加10ml新鲜培养基;
    2. 加入270ul 37%的甲醛,轻轻混匀,室温孵育10分钟;该步骤Z好在通风橱中完成;
    3. 加入1ml 1.25M的苷氨酸,轻轻混匀,室温孵育5分钟,中和甲醛;
    4. 将皿中的混合液吸掉,用预冷的1×PBS/EDTA洗细胞两遍,加入1ml含有1×protease inhibitor cocktail的1×PBS,用细胞刮将皿底的细胞刮下,收集到1.5ml离心管中;
    5. 2000×g离心5分钟,弃上清;
    6. 收集到的样品-80℃冻存,干冰运输
    注:
    1、所使用的1.5 ml冻存管或离心管、枪头等必须高温灭菌,装好样品后管口需要以封口膜封好。
    2、快递运输所用干冰量至少为8公斤,且运输用泡沫箱需用封箱带密封。
     
     

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