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10x Genomics Chromium 3'单细胞转录组测序

产品信息
  • 晶能生物,12台10x Genomics仪器,服务全国!
    单细胞水平的高通量基因表达谱分析
    对复杂细胞群体深入分析,表征单个细胞的表达谱。
    可同时检测CRISPR干扰、细胞表面蛋白,
    避免单个细胞的异质性生物学信息被大量细胞的均质化掩盖。


    >技术原理 Single Cell 3'

    GEM在一个八通道的微流体芯片中产生,大约可形成10万个。每个凝胶珠带有大约750,000个设计好的序列。
    每条序列分别包含:
    (i) Illumina P7 and R2 sequence (read 2 sequencing primer)
    (ii) 16bp 10x Barcode
    (iii) 10bp randomer to index molecules (unique molecular identifier, UMI)
    (iv) poly-dT primer sequence

     
    GEM形成后,细胞裂解,凝胶珠自动溶解释放大量barcode序列,随后mRNA逆转录为cDNA。
    油滴破碎,cDNA为模板进行PCR扩增,然后进行cDNA打断、加测序接头P5及测序引物R1等传统二代测序的建库过程。
     
    (图片来源:10x Genomics ChromiumSingleCell3’SolutionApplication)

    >技术优势
    (i)   一次测序可同时上8个样本,每个样本可捕获几千个细胞;
    (ii)  相对于其他平台,单细胞测序的成本较低;
    (iii) 适合研究复杂的细胞群体;
    (iv) 无需分选细胞,就可以实现单细胞测序

    >样本要求
    细胞状态
    单细胞悬浮液(细胞悬浮液由客户自己制备),悬浮液中细胞不能成团,少碎片,存活率>90%,细胞直径<30µm;不能存在逆转录YZ剂及非细胞的核酸分子。
    细胞数量
    总量>2×105个,同一个细胞平行准备2份(1份质检,1份实验)
    细胞运输
    细胞在冻存液中,利用干冰保护运输,请先预估运输时间,确保运输过程中有足够的干冰(有条件的客户用液氮运输为ZJ)。

    >生物信息学分析



    >应用方向



    > 延伸应用
    Single Cell Gene Expression 和 Cell Surface Proteins技术联合
    联合优势
    >>>测量细胞表面蛋白标记物、剪接亚型和翻译后修饰,以识别细胞类型和状态,并检测罕见的细胞类型
    >>>检测RNA水平难以测量的标记物
    >>>评估mRNA和蛋白表达谱的差异
    >>>与单独的转录组测量相比,获得更详细的细胞表型特征
     
    应用方向
    癌症
    >>>研究癌症的发病途径和其他复杂的生物系统
    >>>识别不同类型癌症的生物标志物
    >>>基于蛋白质和/或转录本的癌症药物开发
    >>>更全面的肿瘤微环境分析
     
    免疫学
    >>>研究受体、细胞、应答细胞数量水平上的机制
    >>>研究淋巴细胞与靶细胞之间的动态相互作用
    >>>T细胞基因工程和基于TCR的融合蛋白筛选
    >>>开发有效的接种疫苗 (抗体筛选)
     
    神经科学与传染病
    >>>发现罕见的细胞类型和新的生物标记
    >>>更完整的通路和细胞信号分析
     
    人体细胞图谱/组织编目
    >>>增强组织和器官的表型
    >>>构建更完整的框架以更好地了解疾病状态


    >我们的优势

    (i)   多家ZD合作单位;
    (ii)  处理过多种细胞,有丰富的建库经验-人、小鼠或其他物种的培养细胞或组织细胞,包括PBMC、神经细胞、肿瘤细胞、细胞、胚胎细胞、免疫细胞、干细胞等等;
    (iii) 提供个性化服务-带仪器上门服务,完成10x单细胞建库;根据您的需求进行个性化分析。
              (持续更新中)
  • 信息声明:本产品供应信息由仪器网为您整合,供应商为(晶能生物技术(上海)有限公司),内容包括 (10x Genomics Chromium 3'单细胞转录组测序)的品牌、型号、技术参数、详细介绍等;如果您想了解更多关于 (10x Genomics Chromium 3'单细胞转录组测序)的信息,请直接联系供应商,给供应商留言!
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