小麦 90K SNP芯片

       小麦是重要的经济作物，其全基因组测序于2012年完成。Illunima公司根据小麦完整的基因组信息，率先设计并推出了基于其独特的微珠合成技术的小麦全基因组SNP检测芯片，小麦 90K SNP芯片。该芯片由Illumina公司与众多国际DJ的研究单位合作开发，位点信息覆盖度广，准确度高，基本涵盖了小麦分子育种中涉及的主要SNP信息。
       小麦ﾠ90KﾠSNP芯片的位点包含了小麦典型物种的70,000个SNP位点及保守同源基因的5,000个SNP位点，T.durum物种的2,000~3,000 个 SNP 位点，Aegilops tauschii 物种的 5,000个SNP，1,000个第7组染色体的SNP位点等。




数据结果展示

应用案例

全基因组连锁分析发现小麦黑胚病相关QTL
 

• 研究背景

      小麦黑胚病是一种真菌病害。小麦感病后，胚部会产生黑点，降低麦粒品质，造成严重经济损失。本研究以小麦重组自交系（RIL）群体的273株小麦为材料，利用小麦90K SNP芯片，发现了9个与小麦黑胚病抗性相关数量性状位点（QTL）。​
 

• 研究路线

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• 参考文献

       ​Liu J, He Z, Wu L, et al. Genome-wide linkage mapping of QTL for black point reaction in bread wheat (Triticum aestivum L.)[J].Theoretical and Applied Genetics, 2016, 129(11): 2179-2190.

• 博奥晶典支持发表相关文献

​1. Wang J, Wen W, Hanif M, et al. TaELF3-1DL, a homolog of ELF3, is associated with heading date in bread wheat[J]. MolecularBreeding, 2016, 36(12): 161.
2. Chen C, He Z, Lu J, et al. Molecular mapping of stripe rust resistance gene YrJ22 in Chinese wheat cultivar Jimai 22[J]. MolecularBreeding, 2016, 36(8): 118.
3. Jin H, Wen W, Liu J, et al. Genome-Wide QTL Mapping for Wheat Processing Quality Parameters in a Gaocheng 8901/Zhoumai16
Recombinant Inbred Line Population[J]. Frontiers in Plant Science, 2016, 7.
4. Dong Y, Zhang Y, Xiao Y, et al. Cloning of TaSST genes associated with water soluble carbohydrate content in bread wheat stemsanddevelopment of a functional marker[J]. Theoretical and Applied Genetics, 2016, 129(5): 1061-1070.