lncRNA测序

在Z近十余年的生命科学研究中，对具有重要调控功能的非编码RNA的研究可谓是其中Z引人关注的领域之一，而长链非编码RNA（long non-coding RNAs，lncRNAs）一经登场，便迅速成为非编码RNA界又一个耀眼的明星。lncRNAs是一类长度大于200 nt的非编码RNA，广泛存在于各种生物体内，在表观遗传、转录以及转录后等多种水平上对生命活动进行关键性的调控，与动植物的生长发育，人类的疾病发生有着密切关系，也可作为疾病诊断的标志物或是重要靶点。联川生物推出的lncRNA测序服务，使用高通量测序技术结合的生物信息学分析平台，助您全面深入地开启lncRNA研究。   采用核糖体去除技术和链特异性文库构建方案，保留了完整的lncRNA和mRNA序列，以及序列方向性。 对包括人和动植物在内的许多物种的lncRNA展开分析。 对样本中几乎全部的lncRNA和mRNA序列进行鉴定和分析。 系统收集lncRNA数据库用于鉴定已知lncRNA，并设置严格的筛选条件用于发现新lncRNA。 展开lncRNA与mRNA的关联分析，深入分析lncRNA调控网络。     Gut：利用测序技术研究lncRNA对食管癌增殖与转移的调控作用 本研究采用RNA-Seq技术，对食管腺癌组织和配对的正常组织中的lncRNA进行鉴定和差异表达分析。共发现6216个lncRNAs在食管腺癌组织中表达，其中lncRNA HNF1A-AS1显著过表达。敲除HNF1A-AS1能YZ食管腺癌细胞的增殖与转移，并YZ癌症相关lncRNA H19的表达。研究表明，HNF1A-AS1的失调参与了食管癌的发生，而该参与过程有可能部分受到染色质与核小体组装的改变及H19诱导的调节。 Yang X. et al.（2013）Long non-coding RNA HNF1A-AS1 regulates proliferation and migration in oesophageal adenocarcinoma cells.Gut. doi: 10.1136/gutjnl-2013-305266.   New Phytol：利用测序技术研究拟南芥lncRNA应答尖孢镰刀菌侵染的分子机制       尖孢镰刀菌（F. oxysporum）是一种世界性分布的土传病原真菌，寄主范围广泛，可引起包括拟南芥和重要经济作物如棉花和番茄等100多种植物发生枯萎病，造成严重损失。 本研究采用链特异性RNA-Seq技术，对拟南芥中应答F. oxysporum侵染的lncRNA展开分析。实验发现许多与F. oxysporum侵染应答相关的lncRNA，包括15个长链非编码天然反义转录本（lncNATs）和20个lincRNAs。实验证实上述部分的lncNATs和lincRNAs与拟南芥的F. oxysporum抗性密切相关。研究表明，链特异性RNA-Seq是发现隐藏着的转录组的有力工具，并证实lncRNAs是拟南芥抗真菌网络中重要的节点。 Zhou QK.（2013）Long noncoding RNAs responsive to Fusarium oxysporum infection inArabidopsis thaliana.New Phytology. DOI: 10.1111/nph.12537