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医学全基因组甲基化测序

产品信息
  • 全基因组甲基化测序（Whole Genome Bisulfate Sequencing）是指利用重亚硫酸盐对全基因组DNA进行处理，可使未甲基化修饰的胞嘧啶碱基转化为尿嘧啶碱基，然后利用高通量测序在全基因组范围内检测所有的甲基化位点，绘制单碱基分辨率的DNA甲基化图谱。通过全基因组甲基化测序可以全面了解胚胎发育、衰老、疾病过程中表观遗传差异的作用机理，为相关研究提供指导。

    应用研究
    探索发育过程中DNA甲基化的调控作用：比较不同发育阶段DNA甲基化差异及其mRNA表达量的改变，揭示发育过程中表观遗传的调控机理。
    研究表观遗传变异致病机理：通过对疾病和正常组织进行DNA甲基化测序分析两者间差异，揭示DNA甲基化在疾病发SF展过程中所起的作用，阐明疾病发生机理。
    筛选疾病相关甲基化标志物：通过比较疾病和正常组织或者疾病不同阶段组织DNA甲基化差异，筛选与疾病相关的DNA甲基化标记物，利于疾病的预防和诊断。
                          
        全基因组甲基化图谱                                                 不同基因区域内DNA甲基化水平

    经典案例解析
    全基因组甲基化测序揭示成神经管细胞瘤中DNA甲基化调控作用
    Decoding the regulatory landscape of Medulloblastoma using DNA methylation sequencing. nature. 2014
    成神经管细胞瘤是一种高度恶性原发性脑肿瘤，产生于小脑和颅后窝。分为4个亚型： WNT-pathway-activated, SHH-pathway-activated，所知较少的Group 3 和 Group 4。本研究通过对34个人成神经管细胞瘤组织（每种亚型5-12例不等）及8个正常组织对照（成人组及婴儿组各4例）进行了全基因组甲基化测序，发现相比于正常对照，肿瘤组织的甲基化水平明显降低，尤其是非CpG岛位点，甲基化位点集中分布于转录起始位点下游数kb处，提示与基因的表达量有密切关系。通过与转录组测序结果的联合分析，发现甲基化水平高的基因表达程度低，并且在Group 3 和 Group 4发现一些新的成神经管细胞瘤相关基因。
                              
         基因甲基化与基因表达热图                                                            成神经管细胞瘤相关基因
     
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