染色质免疫共沉淀测序技术（ChIP-seq）

产品提供商：易基因生物


服务名称: 染色质免疫共沉淀（CHIP-seq）科研服务


染色质免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)，是研究体内蛋白质与DNA相互作用的经典方法。将ChIP与高通量测序技术相结合的ChIP-Seq技术，可在全基因组范围对特定蛋白的DNA结合位点进行GX而准确的筛选与鉴定，为研究的深入开展打下基础。不同组蛋白的差异性修饰与基因的转录、染色质的空间构型和构象密切相关。


原理：运用某一修饰的特定组蛋白的特异性抗体富集与其结合的DNA片段，并进行纯化和文库构建，然后进行高通量测序，通过将获得的数据与参考基因组精确比对，研究人员可获得全基因组范围内某种修饰类型的特定组蛋白与基因组DNA序列之间的关系，也可对多个样品进行差异比较。
 

 
 

                     
技术优势：






实验策略：



分析内容：
 

 
 
送样要求：


样品要求：细胞不少于10⁷，客户交联后干冰寄送并提供抗体
DNA送样量：接收所有物种富集后的DNA建库测序服务DNA量不低于5ng
样品纯度DNA片段大小:分布在100~500bp范围，且主带明显。需提供DNA打断后的检测胶图；
CHIP标准抗体：H3K4Me3、H3K4Me2、H3K9Me3、H3K9Me2、H3K27Me3、H3K27Me2等。
推荐数据量：20M~40M clean reads。
织发育、干细胞自我更新和分化、热休克或DNA损伤应答、癌症的发生与发展、药物应答等研究领域。
样品浓度：建议≥100ng/uL：
应用范围：适用于转录因子结合位点或组蛋白修饰位点的研究。
周期：25个以下的免疫沉淀后的DNA样品，标准流程（仅包括标准信息分析）的运转周期约为30个工作日；
          12个以下的细胞系样品，标准流程（仅包括标准信息分析）的运转周期约为50个工作日；
           样品数更多时，项目周期根据项目规模而定。
推荐测序模式：Illumina，PE150    ● 推荐8G/10G数据量 ● 测序深度30X
 
 
 
研究案例：




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表 观 基 因 组 学	BS类	IP类	染色质类	转 录 组 学	sc RNA	微 生 物 组 学	Meta	多 组 学 分 析	scWGBS+scRNA
	WGBS	MeDIP	ATAC-seq		lncRNA		扩 增 子 测 序		LHC-BS+ssRNA
	scWGBS	hMeDIP			原核转录组
	RRBS/dRRBS	CHIP			有/无参考基因组
	oxBS	6mA			ceRNA
	ACE-seq	m6A
	LHC-BS