课题研究实验外包蛋白质研究——蛋白质组学

一、服务介绍

蛋白组定量是对一个基因组表达的全部蛋白质或一个复杂混合体系内所有蛋白质进行精确的定量和分析，可用于筛选和寻找任何因素引起的样本之间的蛋白差异表达，揭示细胞生理病理功能，同时也可对某些关键蛋白进行定性和定量分析。我们为用户提供基于iTRAQ和SILAC技术进行的蛋白组定量分析服务。

二、服务类型

iTRAQ ( Isobaric Tags for Relative and Absolute Quantitation) 技术是一项体外同位素标记技术。使用该技术可以对一个基因组表达的全部蛋白质或一个复杂的混合体系中的所有蛋白质进行精确定量和鉴定。

服务流程

1 提取蛋白、酶解生成肽段

2 标记肽段样品

3 LC-MS/MS测试

4 蛋白质鉴定及统计

SILAC（Stable Isotope Labeling with Amino acids in Cell culture）技术是另一种常用的蛋白组定量技术，使用同位素标记的必需氨基酸取代细胞培养基中相应氨基酸，细胞经5-6个倍增周期后，稳定同位素标记的氨基酸完全掺入到细胞新合成的蛋白质中替代了原有氨基酸，然后可对细胞中的蛋白质进行质谱鉴定和定量数据分析

服务流程

1 稳定同位素标记与标记效率检测

2 对照组和实验组细胞扩大培养

3 细胞组分总蛋白的提取和酶解

4 液质联用串联质谱分析

三、数据分析项目

标准分析：数据格式转换、peptide质量筛选、蛋白拼接与鉴定、GO功能注释、代谢通路分析、COG分析

高级分析：蛋白质结构分析、蛋白质相互作用分析、蛋白质YZ剂筛选